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J-GLOBAL ID：201802235262392481   整理番号：18A0856488

2015~2016年のインドネシアの小児における主要な株としてのウマ様のロタウイルス株【JST・京大機械翻訳】

Equine-like G3 rotavirus strains as predominant strains among children in Indonesia in 2015-2016

著者 (18件)： Utsumi Takako (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Utsumi Takako (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Wahyuni Rury Mega (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Doan Yen Hai (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Dinana Zayyin (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Soegijanto Soegeng (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Fujii Yoshiki (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Juniastuti (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Yamani Laura Navika (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Matsui Chieko (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Deng Lin (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Abe Takayuki (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan) ,  Soetjipto (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Lusida Maria Inge (Indonesia-Japan Collaborative Research Center for Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, Institute of Tropical Disease, Airlangga University, Surabaya, Indonesia) ,  Ishii Koji (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Shimizu Hiroyuki (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Tokyo, Japan) ,  Shoji Ikuo (Center for Infectious Diseases, Kobe University Graduate School of Medicine, Kobe, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 61  ページ： 224-228  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ロタウイルスA(RVA)は,世界中のヒトおよび動物における急性胃腸炎の主要な原因である。ロタウイルスゲノムのセグメント化された性質の結果として,遺伝的再集合が一般的に起こる。本研究はインドネシアで循環するRVASの遺伝的特徴を明らかにすることを目的とした。2015年6月から2016年8月までに,インドネシア,Surabayaの私立病院で入院した急性胃腸炎を有する<5歳(71人の男性と63人の女性)の134人の子供から糞便試料を収集した。すべての糞便試料を,免疫クロマトグラフィーを用いてRVA抗原に対してスクリーニングした。42試料(31.3%,42/134)はRVA抗原陽性であった。試験した全てのRVA陽性試料は,G/Pタイピングおよびポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)により,短いRNAパターンを有するG3P[8](n=36)およびG3P[6](n=3)の異常な組み合わせを示した。次世代配列決定(NGS)による全ゲノム解析を11株について行い,RVA遺伝子型を決定した。11のロタウイルス株はDS様遺伝子骨格を持つことが分かった。9株はG3-P[8]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2ゲノム配列を示し,オーストラリア,ハンガリー,スペイン及びブラジルで最近報告された。同様に,2つの株はG3-P[6]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2ゲノム配列を示した。VP7遺伝子に基づく系統樹は,すべての11株が遺伝子的に異なり,典型的なヒトG3株由来の起源が異なるウマ様G3と分類されることを示した。NSP4遺伝子に基づく系統樹は,6つの株がウシ様株として分類され,残りの5つはヒト株と分類されたことを示した。結論として,著者らは,DS-1様遺伝的骨格を持つ,ウマ様G3 VP7,P[8]/P[6]VP4を含む遺伝子間組換え体である株を同定した。これらの知見は,ウマ様のG3P[8]とP[6]RVA株が少なくとも1年にわたってインドネシア人集団で循環しており,おそらくより長いことを示唆しており,この地域におけるRVASの多様性を示している。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNA【核酸】 ,  男性 ,  *ロタウイルス ,  *インドネシア共和国 ,  遺伝子型 ,  遺伝子 ,  遺伝 ,  スペイン ,  抗原 ,  系統樹 ,  ヒト ,  *子供 ,  ブラジル連邦共和国
準シソーラス用語： 胃腸炎 ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ロタウイルス ,  RVA ,  胃腸炎 ,  ウマ ,  インドネシア ,  遺伝的再集合

分類 (5件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  生物物理的研究法  (EA03020V) ,  測光と光検出器一般  (BD07031F) ,  微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (5件)： インドネシア ,  小児 ,  株 ,  ウマ ,  ロタウイルス