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J-GLOBAL ID：201802237387266157   整理番号：18A0806175

ニガウリ(Momordica charantia)における単純配列反復の全ゲノム解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Analysis of Simple Sequence Repeats in Bitter Gourd (Momordica charantia)

著者 (9件)： Cui Junjie (College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Cheng Jiaowen (College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Nong Dingguo (College of Agriculture, Guangxi University) ,  Peng Jiazhu (College of Horticulture, South China Agricultural University) ,  Hu Yafei (BGI Genomics, BGI-Shenzhen) ,  He Weiming (BGI Genomics, BGI-Shenzhen) ,  Zhou Qianjun (General Station of the Administration of Seeds Guangdong Province) ,  Dhillon Narinder P. S. (AVRDC - The World Vegetable Center, East and Southeast Asia, Research and Training Station) ,  Hu Kailin (College of Horticulture, South China Agricultural University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1103  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ニガウリ(Momordica charantia)は多くのアジア及びアフリカ諸国において野菜及び薬用ハーブとして広く栽培されている。キュウリ(Cucumis sativus),スイカ(Citullus lanatus)およびメロン(Cucumis melo)ゲノムの配列決定の後,苦いgourdは,全ゲノムが配列決定された4番目のククルビット種になった。しかしながら,3つの前述のククルビット種との比較を含む,苦いグッドにおける単純な配列反復(SSR)の包括的な分析はまだ発表されていない。ここで著者らは,苦いgourd系統「Dali-11」および「OHB3-1」のゲノムにおいて,それぞれ188,091および167160SSRモチーフを同定した。次に,SSR含有量,モチーフ長,および分類されたモチーフ型を,苦味のあるゲノムについて特性化し,すべてのキュウリのゲノムの間で比較した。最後に,in silico SSRプライマー対における138,727の独特の大きなセットを,苦味のために設計した。これらの中で,71のプライマーを選択し,それらの全ては,2つの苦いgourd系統「Dali-11」と「K44」からSSRを増幅することに成功した。ユニークなSSRプライマーの利用をさらに調べるために,21のSSRマーカーを用いて,世界中のすべてから211の苦いgourd系統の収集を遺伝子型にした。モデルベースのクラスタリング法と系統発生分析は,地理的グループ間の明確な分離を示した。本研究で開発されたゲノムSSRマーカーは,苦味研究の進歩においてかなりの潜在的価値を有している。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 地理学 ,  キャラクタリゼーション ,  ハーブ ,  アフリカ ,  遺伝子型 ,  キュウリ ,  苦味 ,  アジア ,  メロン ,  *ゲノム ,  スイカ
準シソーラス用語： 系統解析 ,  マイクロサテライトマーカー ,  *全ゲノム解析 ,  *Momordica charantia , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bitter Gourd ,  ククルビット ,  単純配列反復(SSR) ,  分子マーカー ,  遺伝的多様性

分類 (2件)： 野菜とその加工品  (FJ11020O) ,  野菜  (FC03043X)

タイトルに関連する用語 (4件)： ニガウリ ,  Momordica ,  反復 ,  全ゲノム解析