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J-GLOBAL ID：201802239343319868   整理番号：18A0974782

多領域および単一細胞シークエンシングは直腸癌における可変ゲノム不均一性を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Multi-region and single-cell sequencing reveal variable genomic heterogeneity in rectal cancer

著者 (10件)： Liu Mingshan (Biodynamics Optical Imaging Center (BIOPIC), School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Liu Yang (Biodynamics Optical Imaging Center (BIOPIC), School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Di Jiabo (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China) ,  Su Zhe (Biodynamics Optical Imaging Center (BIOPIC), School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Yang Hong (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China) ,  Jiang Beihai (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China) ,  Wang Zaozao (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China) ,  Zhuang Meng (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China) ,  Bai Fan (Biodynamics Optical Imaging Center (BIOPIC), School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Su Xiangqian (Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research (Ministry of Education), Department of Gastrointestinal Surgery IV, Peking University Cancer Hospital & Institute, Beijing, China)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 787  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結腸直腸癌は複雑な分子サブタイプを有する悪性腫瘍の不均一群である。結腸癌は広く研究されているが,直腸癌に関する研究は非常に限られている。本研究では,直腸腫瘍のゲノム腫瘍内不均一性(ITH)を調べるために,多領域全ゲノム配列決定と単一細胞全ゲノム配列決定を行った。著者らは,同じ分子分類の腫瘍を有する2つの直腸癌患者から9つの腫瘍領域と88の単一細胞を配列して,それらの突然変異プロフィールと多領域における体細胞コピー数変化(SCNAs)と単一細胞レベルを特性化した。2人の患者の間で,様々な程度のゲノム不均一性が観察され,ITHの程度は単一細胞レベルで分析されたときに増加した。著者らは,主要なSCNAsが癌発生における初期イベントであり,着実に継承されていることを見出した。単一細胞配列決定により,バルク配列決定で隠された変異とSCNAsを明らかにした。まとめると,著者らは,局所的および単一細胞解像度における直腸癌のITHを研究し,可変性不均一性が2人の患者に存在することを示した。同じ分子サブタイプからの治療を受けていない2人の患者の突然変異シナリオとSCNAプロファイルは全く異なっている。著者らの結果は,各腫瘍がそれ自身の構造を有することを示唆し,それは異なる診断,予後,および薬物応答をもたらす可能性がある。2名の患者において顕著なITHが存在し,直腸癌におけるITHの予備的印象を提供した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 発癌 ,  患者 ,  突然変異 ,  *不均一性 ,  結腸腫瘍 ,  体細胞 ,  *直腸腫瘍 ,  腫瘍 ,  コピー数 ,  キャラクタリゼーション ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  サブタイプ ,  結腸直腸癌 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 直腸癌 ,  単一細胞全ゲノム配列決定 ,  多領域全エクソーム配列決定 ,  体細胞コピー数の変化 ,  非均質性

分類 (2件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (48件)：

• Lancet; Colorectal cancer; H Brenner, M Kloor, CP Pox; 383; 2014; 1490-1502; 10.1016/S0140-6736(13)61649-9; citation_id=CR1
• Nature; Comprehensive molecular characterization of human colon and rectal cancer; ; 487; 2012; 330-337; 10.1038/nature11252; citation_id=CR2
• Cancer Treat Rev; Rectal and colon cancer: not just a different anatomic site; K Tamas, AM Walenkamp, EG de Vries, MA van Vugt, RG Beets-Tan, B van Etten; 41; 2015; 671-679; 10.1016/j.ctrv.2015.06.007; citation_id=CR3
• Nat Med; Subclonal diversification of primary breast cancer revealed by multiregion sequencing; LR Yates, M Gerstung, S Knappskog, C Desmedt, G Gundem, P Van Loo; 21; 2015; 751-759; 10.1038/nm.3886; citation_id=CR4
• Oncogene; Multiple region whole-exome sequencing reveals dramatically evolving intratumor genomic heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma; W Cao, W Wu, M Yan, F Tian, C Ma, Q Zhang; 4; 2015; e175; 10.1038/oncsis.2015.34; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 単一細胞 ,  シークエンシング ,  直腸癌 ,  ゲノム ,  不均一性