文献

J-GLOBAL ID：201802243295739652   整理番号：18A0966436

植物におけるロイシンに富む反復受容体様蛋白質キナーゼ(LRR-RLK)遺伝子の起源と多様化【JST・京大機械翻訳】

Origin and diversification of leucine-rich repeat receptor-like protein kinase ( LRR-RLK ) genes in plants

著者 (5件)： Liu Ping-Li (College of Biological Sciences and Biotechnology, Beijing Forestry University, Beijing, China) ,  Du Liang (College of Biological Sciences and Biotechnology, Beijing Forestry University, Beijing, China) ,  Huang Yuan (College of Life Sciences, Peking University, Beijing, China) ,  Gao Shu-Min (College of Biological Sciences and Biotechnology, Beijing Forestry University, Beijing, China) ,  Yu Meng (College of Biological Sciences and Biotechnology, Beijing Forestry University, Beijing, China)
資料名： BMC Evolutionary Biology (Web)  (BMC Evolutionary Biology (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 47  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7052A  ISSN： 1471-2148  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ロイシンに富む反復受容体様蛋白質キナーゼ(LRR-RLK)は,植物における受容体様キナーゼの最大群であり,発生およびストレス応答において重要な役割を果たす。LRR-RLK遺伝子間の進化的関係を開花植物において調べた。しかしながら,より多くの祖先グループにおいてこれらの遺伝子に関する包括的研究は行われていない。植物におけるLRR-RLK遺伝子のサブファミリー分類,進化史及び各LRR-RLKサブファミリーの進化に対する駆動力は理解されていない。【結果】著者らは,Physcomitrella patensコケゲノムにおける119のLRR-RLK遺伝子,Selaginella moellendorffii lycophyteゲノムにおける67のLRR-RLK遺伝子,および5つの緑藻ゲノムにおけるLRR-RLK遺伝子を同定した。さらに,Arabidopsis thalianaおよびOryza sativa由来の以前に報告されたLRR-RLK配列と共に,これらのLRR-RLK配列を進化解析にかけた。系統発生分析により,植物LRR-RLKは19のサブファミリーに属し,そのうちの18は初期の土地植物において確立され,そのうちの1つは開花植物において進化したことを明らかにした。さらに重要なことに,ほとんどのサブファミリーに対するLRR-RLK遺伝子の基本構造は初期の植物において確立され,サブファミリー内および異なる植物系統にわたって保存されているが,サブファミリー間では分岐していることを見出した。加えて,同じサブファミリーのほとんどのメンバーは共通の蛋白質モチーフ組成を有していたが,異なるサブファミリーのメンバーは蛋白質モチーフ組成の変化を示した。各サブファミリーのユニークな遺伝子構造と蛋白質モチーフ組成はサブファミリー分類を区別し,より重要なことに,LRR-RLKサブファミリー間の機能的相違の証拠を提供する。最大尤度分析は,4つのサブファミリーの中のいくつかのサイトが正の選択の下にあることを示した。【結論】植物LRR-RLK遺伝子の多様性は,初期の土地植物において確立された。陽性選択は少数のLRR-RLKサブファミリーの進化に寄与した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  *遺伝子 ,  開花 ,  緑藻類 ,  Arabidopsis thaliana ,  *多様化 ,  *受容体 ,  ゲノム ,  最尤法 ,  *タンパク質キナーゼ ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  分枝鎖アミノ酸
準シソーラス用語： 系統解析 ,  Physcomitrella patens ,  ストレス応答 ,  受容体キナーゼ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： LRR-RLK遺伝子 ,  機能的発散 ,  遺伝子構造 ,  モチーフ ,  正の選択

分類 (5件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物の生化学  (EH01050J) ,  植物生理学一般  (EH02010Y) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： ロイシン

引用文献 (75件)：

• Shiu SH, Bleecker AB. Receptor-like kinases from Arabidopsis form a monophyletic gene family related to animal receptor kinases. Proc Natl Acad Sci U S A. 2001;98(19):10763-10768.
• BMC Genomics; Genome-wide cloning and sequence analysis of leucine-rich repeat receptor-like protein kinase genes in Arabidopsis thaliana; X Gou, K He, H Yang, T Yuan, H Lin, SD Clouse, J Li; 11; 2010; 19; 10.1186/1471-2164-11-19; CR2;
• Plant J; Crystal structures of the phosphorylated BRI1 kinase domain and implications for brassinosteroid signal initiation; D Bojar, J Martinez, J Santiago, V Rybin, R Bayliss, M Hothorn; 78; 1; 2014; 31-43; 10.1111/tpj.12445; CR3;
• Science; The protein kinase family: conserved features and deduced phylogeny of the catalytic domains; SK Hanks, AM Quinn, T Hunter; 241; 4861; 1988; 42-52; 10.1126/science.3291115; CR4;
• FASEB J; Protein kinases 6. The eukaryotic protein kinase superfamily: kinase (catalytic) domain structure and classification; SK Hanks, T Hunter; 9; 8; 1995; 576-96; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 植物 ,  ロイシン ,  反復 ,  受容 ,  蛋白質キナーゼ ,  遺伝子 ,  起源 ,  多様化