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J-GLOBAL ID：201802243406749386   整理番号：18A1114812

系統特異的な倍数化はゲノム重複と進化的多様化の間の時間遅れを説明する機構である【JST・京大機械翻訳】

Lineage-specific rediploidization is a mechanism to explain time-lags between genome duplication and evolutionary diversification

著者 (12件)： Robertson Fiona M. (Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen, UK) ,  Gundappa Manu Kumar (Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen, UK) ,  Grammes Fabian (Centre for Integrative Genetics (CIGENE), Faculty of Biosciences, Norwegian University of Life Sciences, Ås, Norway) ,  Hvidsten Torgeir R. (Department of Chemistry, Biotechnology and Food Science, Norwegian University of Life Sciences, Ås, Norway) ,  Hvidsten Torgeir R. (Umea Plant Science Centre, Department of Plant Physiology, Umea Plant Science Centre, Umea University, Umea, Sweden) ,  Redmond Anthony K. (Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen, UK) ,  Redmond Anthony K. (Centre for Genome-Enabled Biology & Medicine, University of Aberdeen, Aberdeen, UK) ,  Lien Sigbjorn (Centre for Integrative Genetics (CIGENE), Faculty of Biosciences, Norwegian University of Life Sciences, Ås, Norway) ,  Martin Samuel A. M. (Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen, UK) ,  Holland Peter W. H. (Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Sandve Simen R. (Centre for Integrative Genetics (CIGENE), Faculty of Biosciences, Norwegian University of Life Sciences, Ås, Norway) ,  Macqueen Daniel J. (Institute of Biological and Environmental Sciences, University of Aberdeen, Aberdeen, UK)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 111  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】全ゲノム重複(WGD)から保持された重複遺伝子(ohnologies)の機能的多様性は進化的多様化を促進すると考えられている。しかし,種の放射と表現型の多様化は,しばしばWGDから時間的に分離される。その祖先が自己四倍化~95百万年前にWGDを受けたサケ科魚類は,後WGD放射のそのような時間遅れモデルに適合し,それは,再構成過程における主要な遅れに沿って起こった。ここで,著者らは,モデル,「系統特異的なohnologue分解能」(lor)を提案し,Delid rediploidizationの結果を扱った。lorの下では,種分化は再分化に先行し,祖先のWGDイベントを共有する姉妹系統における独立したohログの発散を可能にする。【結果】交差種配列捕捉,系統発生学,およびohnologue発現分岐の全ゲノム解析を用いて,著者らは,salmonid進化に及ぼすロlorの主要な影響を実証する。少なくとも4550のohnologiesを持つ各サケ科ゲノムの1/4は,lorの下で進化し,複数の独立した機会>50百万年後のWGDにおいて,再構成と機能的な発散が起こった。著者らは,潜在的にサケ科種の放射を促進する系統特異的生理学的適応における機能を持つ多くのロlorの存在と調節の相違を示す。著者らは,以前のohologが,salmonid祖先において多様化を始めた「古い」よりも異なる機能に富んでいることを示す。【結論】lorは,遺伝子の機能的性質に影響を及ぼすポストWGD発散の入れ子成分としての有意な有意性を持たないが,系統特異的適応のみに利用可能なohnologiesを提供する。多くのWGDイベントに従って予測されるlorの下では,WGDの機能的成果は,爆発的には現れないが,数百万年にわたって徐々に発生し,優勢な生態学的圧力下での系統特異的多様化体制を促進する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生態学 ,  *多様化 ,  再構成 ,  表現型 ,  サケ科 ,  生理学 ,  遺伝子 ,  捕獲 ,  *遺伝子重複 ,  *ゲノム ,  分解能
準シソーラス用語： 全ゲノム解析 ,  再分化 ,  オーバーラップ遺伝子 ,  *倍数体化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 全ゲノム重複 ,  放射化 ,  種の放射線 ,  系統特異的なOHNOLOGE解像度(LORE) ,  重複遺伝子 ,  機能的発散 ,  自動四倍化 ,  サケ科魚類

分類 (2件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (83件)：

• Nat Rev Genet.; The evolutionary significance of ancient genome duplication; Y Peer, S Maere, A Meyer; 10; 2009; 725-32; 10.1038/nrg2600; CR1;
• Proc Biol Sci.; Polyploidy in fungi: evolution after whole-genome duplication; W Albertin, P Marullo; 279; 2012; 2497-50; 10.1098/rspb.2012.0434; CR2;
• Mol Genet Genomics.; Whole-genome duplication in teleost fishes and its evolutionary consequences; SM Glasauer, SC Neuhauss; 289; 2014; 1045-60; 10.1007/s00438-014-0889-2; CR3;
• Curr Opin Genet Dev.; Polyploidy and genome evolution in plants; PS Soltis, DB Marchant, Y Peer, DE Soltis; 35; 2015; 119-25; 10.1016/j.gde.2015.11.003; CR4;
• Nat Rev Genet.; The advantages and disadvantages of being polyploid; L Comai; 6; 2005; 836-46; 10.1038/nrg1711; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 系統 ,  倍数化 ,  ゲノム重複 ,  進化 ,  多様化 ,  時間遅れ ,  説明