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J-GLOBAL ID：201802243961915422   整理番号：18A1813148

Methylobacterium extorquensりんご酸デヒドロゲナーゼの構造により明らかにされた基質結合の立体配座変化【JST・京大機械翻訳】

Conformational changes on substrate binding revealed by structures of Methylobacterium extorquens malate dehydrogenase

著者 (6件)： Gonzalez Javier M. (Instituto de Bionanotecnologia del NOA, Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas, Universidad Nacional de Santiago del Estero, G4206XCPSantiago del Estero, Argentina) ,  Gonzalez Javier M. (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM87545, USA) ,  Marti-Arbona Ricardo (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM87545, USA) ,  Chen Julian C.-H. (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM87545, USA) ,  Broom-Peltz Brian (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM87545, USA) ,  Unkefer Clifford J. (Bioscience Division, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM87545, USA)
資料名： Acta Crystallographica Section F  (Acta Crystallographica Section F)
巻： 74  号： 10  ページ： 610-616  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2479A  ISSN： 2053-230X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メチロトローフMethylobacterium extorquens AM1からのリンゴ酸デヒドロゲナーゼ(MDH;EC1.1.37)の3つの高分解能X線結晶構造を提示した。アポMDHの構造を比較することにより,MDHとNAD+の二成分複合体,及びピリジンヌクレオチド結合部位を占めるADP-リボースとMDH及びオキサロ酢酸の三成分複合体,触媒複合体の形成に関連した立体配座変化を特性化した。基質結合部位は酵素休止状態またはNAD+結合型でアクセス可能であるが,基質結合型は閉鎖立体配座を示す。この立体配座変化は,α-ヘリックスの3_10-ヘリックスへの転移を含み,補酵素と基質結合後の活性部位に近接する隣接ループを引き起こす。三成分錯体において,His284はオキサロ酢酸のC2カルボニルに水素結合を形成し,(2S)-リンゴ酸の形成においてプロトンを供与する位置に配置した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結合部位 ,  複合体 ,  活性部位 ,  補酵素 ,  水素結合 ,  *配座転移 ,  キャラクタリゼーション ,  メチロトローフ ,  *立体配座 ,  結晶構造 ,  触媒 ,  陽子 ,  *基質
準シソーラス用語： *Methylobacterium ,  *Methylobacterium extorquens , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： りんご酸デヒドロゲナーゼ ,  メチロトローフ ,  バイオ燃料 ,  Methylobacterium extorquens

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (4件)： Methylobacterium ,  りんご酸デヒドロゲナーゼ ,  基質 ,  立体配座変化