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J-GLOBAL ID：201802246565584715   整理番号：18A0965994

外生真菌Ramichloridium luteumのゲノム配列は植物表面ニッチへのユニークな進化的適応を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome sequence of the ectophytic fungus Ramichloridium luteum reveals unique evolutionary adaptations to plant surface niche

著者 (5件)： Wang Bo (State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas and College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Liang Xiaofei (State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas and College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Gleason Mark L. (Department of Plant Pathology and Microbiology, Iowa State University, Ames, USA) ,  Zhang Rong (State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas and College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Sun Guangyu (State Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas and College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 729  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】植物性真菌類は,長期間の乾燥,栄養制限,および太陽放射線への曝露によって特徴付けられる極端な環境である,ワキシー性植物表面を占めている。この環境への適応を容易にする機構の性質は不明のままである。本研究では,リンゴ果実の表面にコロニーを形成し,比較ゲノムおよびトランスクリプトーム解析を行った。【結果】R.luteumゲノムは28.18Mbで,1.85%の反復要素を含む9466遺伝子をコードした。細胞貫通病原体と比較して,植物細胞壁分解酵素(PCWDEs),PTH11様G蛋白質共役受容体(GPCR)及びエフェクタをコードする遺伝子は劇的に減少した。対照的に,キチナーゼと分泌性リパーゼをコードする遺伝子は著しく拡大し,9つの分泌リパーゼのうち4つはおそらくBasidiomycotaからの水平遺伝子移動により獲得された。トランスクリプトーム解析はクチクラ分解(cu,分泌リパーゼ)及びストレス応答(メラニン生合成,アクアポリン,リゾチーム及びHOG経路)に関与する遺伝子の発現の上昇を明らかにした。結論:これらの結果は,生態系真菌R.luteumによる表面ニッチ適応の進化に関連するゲノム特徴,すなわちPCWDEsの収縮,PTH11様GPCRsとエフェクタ,クチクラ分解とストレス耐性の拡大を強調する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エフェクタ ,  遺伝子 ,  *ゲノム ,  リパーゼ ,  *真菌類 ,  生態系 ,  分泌 ,  キチナーゼ ,  クチクラ ,  リゾチーム ,  病原体
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  トランスクリプトーム解析 ,  *ニッチ ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Sooty BlotchとFlySpek ,  クチナーゼ ,  分泌リパーゼ ,  進化 ,  ストレスの多い環境

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (85件)：

• Proc Natl Acad Sci U S A; Transcriptional responses of Pseudomonas syringae to growth in epiphytic versus apoplastic leaf sites; X Yu, SP Lund, RA Scott, JW Greenwald, AH Records, D Nettleton; 110; 2013; E425-E434; 10.1073/pnas.1221892110; CR1;
• Annu Rev Phytopathol; The genomics of obligate (and nonobligate) biotrophs; PD Spanu; 50; 2012; 91-109; 10.1146/annurev-phyto-081211-173024; CR2;
• Curr Opin Microbiol; Dissecting endophytic lifestyle along the parasitism/mutualism continuum in Arabidopsis; PH Fesel, A Zuccaro; 32; 2016; 103-112; 10.1016/j.mib.2016.05.008; CR3;
• Curr Res Environ Appl Mycol; Biochemical changes in the Lawsonia inermis L. infected with Asterina lawsoniae Henn. & Nyn; J Thomas, K Mathew; 4; 2014; 217-220; CR4;
• Plant Biol; Does structural parasitism by epiphytes exist? A case study between Tillandsia recurvata and Parkinsonia praecox; A Flores-Palacios; 18; 2016; 463-470; 10.1111/plb.12406; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 真菌 ,  ゲノム配列 ,  植物 ,  ニッチ ,  進化 ,  適応