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J-GLOBAL ID：201802247605706390   整理番号：18A1590122

内皮グリコカリックスの複雑な構造下の流れの大規模分子動力学シミュレーション【JST・京大機械翻訳】

Large-scale molecular dynamics simulation of flow under complex structure of endothelial glycocalyx

著者 (4件)： Jiang Xi Zhuo (Department of Mechanical Engineering, University College London, Torrington Place, London WC1E 7JE, UK) ,  Feng Muye (Department of Mechanical Engineering, University College London, Torrington Place, London WC1E 7JE, UK) ,  Luo Kai H. (Department of Mechanical Engineering, University College London, Torrington Place, London WC1E 7JE, UK) ,  Ventikos Yiannis (Department of Mechanical Engineering, University College London, Torrington Place, London WC1E 7JE, UK)
資料名： Computers & Fluids  (Computers & Fluids)
巻： 173  ページ： 140-146  発行年： 2018年 
JST資料番号： E0859A  ISSN： 0045-7930  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,大規模分子動力学(MD)シミュレーションを行い,内皮グリコカリックス層内の流体力学を研究した。流れ/グリコカリックスシステムの構築に関する作業フローチャート,MD法と後処理を用いた生産シミュレーションを提案した。フローチャートに続いて,生理学的および加速流の事例をシミュレートし,グリコカリックスの樹状突起(樹状)構造上の速度およびせん断応力分布を明らかにし,それにより,流れプロファイルに及ぼす生体分子複合体構造の影響の理解に寄与した。さらに,サーモスタットアルゴリズムの選択について議論した。その結果,強制力が臨界値以下になると,速度は樹枝状グリコカリックスの存在下で高さに沿ってゼロ平均の周りで変動することを示した。強制が臨界値より大きいとき,バルク流は過度に加速され,典型的な生理学的流れから逸脱した。さらに,外部ドメインにおける3つのサブ領域の間のせん断応力の大きさの分布は,せん断応力が膜表面近くで強化されるが,糖鎖による流れの調節により糖鎖に富む領域では損なわれることを示す。最終的に,2つの広く使用されているサーモスタット(Lowe-AndersenとBerendsenサーモスタット)の下での速度発展の比較は,Lowe-Andersonアルゴリズムが流れ問題のための適切なサーモスタットであることを意味する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 糖鎖 ,  *計算機シミュレーション ,  樹状突起 ,  シミュレーション ,  アルゴリズム ,  剪断応力 ,  後処理 ,  *内皮 ,  *分子動力学 ,  流体力学 ,  流れ図 ,  恒温装置 ,  生理学 ,  臨界定数
準シソーラス用語： *分子動力学シミュレーション ,  *グリコカリックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 大規模 ,  分子動力学 ,  流れ ,  内皮糖鎖 ,  複雑な構造

分類 (2件)： 管内流  (BC02090Q) ,  噴流  (BC02080F)

タイトルに関連する用語 (5件)： 内皮 ,  グリコカリックス ,  流れ ,  大規模 ,  分子動力学シミュレーション