文献

J-GLOBAL ID：201802249059004047   整理番号：18A0976292

新規マルチネットワークアプローチは全身性硬化症における線維症の組織特異的細胞調節因子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

A novel multi-network approach reveals tissue-specific cellular modulators of fibrosis in systemic sclerosis

著者 (13件)： Taroni Jaclyn N. (Department of Molecular and Systems Biology, Geisel School of Medicine at Dartmouth, Hanover, USA) ,  Greene Casey S. (Department of Systems Pharmacology & Translational Therapeutics, Perelman School of Medicine, University of Pennsylvania, Philadelphia, USA) ,  Martyanov Viktor (Department of Molecular and Systems Biology, Geisel School of Medicine at Dartmouth, Hanover, USA) ,  Wood Tammara A. (Department of Molecular and Systems Biology, Geisel School of Medicine at Dartmouth, Hanover, USA) ,  Christmann Romy B. (Division of Rheumatology, Department of Medicine, Boston University School of Medicine, Boston, USA) ,  Farber Harrison W. (Pulmonary Center, Department of Medicine, Boston University School of Medicine, Boston, USA) ,  Lafyatis Robert A. (Division of Rheumatology, Department of Medicine, Boston University School of Medicine, Boston, USA) ,  Lafyatis Robert A. (Division of Rheumatology and Clinical Immunology, Department of Medicine, University of Pittsburgh Medical Center, Pittsburgh, USA) ,  Denton Christopher P. (Division of Medicine, University College London, London, UK) ,  Hinchcliff Monique E. (Division of Rheumatology, Department of Medicine, Feinberg School of Medicine, Northwestern University, Chicago, USA) ,  Pioli Patricia A. (Department of Microbiology and Immunology, Geisel School of Medicine at Dartmouth, Lebanon, USA) ,  Mahoney J. Matthew (Department of Neurological Sciences, Larner College of Medicine, University of Vermont, Burlington, USA) ,  Whitfield Michael L. (Department of Molecular and Systems Biology, Geisel School of Medicine at Dartmouth, Hanover, USA)
資料名： Genome Medicine (Web)  (Genome Medicine (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 27  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7320A  ISSN： 1756-994X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:全身性硬化症(SSc)は,皮膚線維症により特徴付けられる多臓器自己免疫疾患である。内部器官の関与は不均一である。疾患機構が全ての影響を受けた組織に共通しているか,または各症状が異なる基礎病理を有するかどうかは不明である。【方法】SSc患者からの4つのSSc影響組織(皮膚,肺,食道,および末梢血)からの生検の遺伝子発現プロファイルを比較するためにコンセンサスクラスタリングを使用し,関連する条件肺線維症(PF)および肺動脈高血圧をすべての組織にわたってコンセンサス疾患関連徴候を誘導した。この特徴を用いて組織特異的機能的ゲノムネットワークを質問した。皮膚と肺微小環境を対比し,各器官における炎症性および線維性遺伝子の機能的役割を評価するために,新規なネットワーク分析を行った。最後に,Wilcoxon順位和検定を用いて皮膚及び肺における濃縮のためのマクロファージ活性化状態関連遺伝子セットの発現を試験した。【結果】著者らは,SScによって影響を受けた複数の組織(皮膚,肺,食道,および末梢血単核細胞)におけるプロ線維症マクロファージ(MOs)の免疫線維性軸索を示す一般的な病原性遺伝子発現を同定した。これらの遺伝子の共発現は全ての組織に共通であるが,このアップレギュレーションの機能的結果は器官により異なる。著者らは,SScおよび関連条件の共通および組織特異的病理を同定するために,組織特異的機能的ゲノムネットワークを質問するために,この疾患関連署名を用いた。皮膚とは対照的に,肺特異的機能的ネットワークにおいて,脂質刺激と代替活性化に関連する明確な肺常在MOシグネチャを同定した。著者らのネットワーク結果により,SSc関連PF肺と「炎症性」SSc遺伝子発現特徴を有する患者の皮膚において異なるMO代替活性化転写プログラムを見出した。結論:自然免疫系はSSc疾患過程に中心的であるが,組織間に微妙な差異が存在することを示唆した。著者らのアプローチは,複雑なヒト疾患における一般的で組織特異的な疾患過程を理解するために,線維症および自己免疫疾患における疾患の分子的特徴を調べるための枠組みを提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 肺線維症 ,  *線維症 ,  生検 ,  患者 ,  末梢血 ,  遺伝子 ,  アップレギュレーション ,  マクロファージ ,  *ネットワーク ,  食道 ,  自己免疫病 ,  炎症 ,  病理 ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： *全身性強皮症 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 全身性硬化症 ,  強皮症 ,  マクロファージ ,  肺疾患 ,  機能ゲノミクス

分類 (1件)： 皮膚の疾患  (GF03000Q)

引用文献 (95件)：

• Greene CS, Krishnan A, Wong AK, Ricciotti E, Zelaya RA, Himmelstein DS, Zhang R, Hartmann BM, Zaslavsky E, Sealfon SC, Chasman DI, FitzGerald GA, Dolinski K, Grosser T, and Troyanskaya OG. Understanding multicellular function and disease with human tissue-specific networks. Nat Genet. 2015;47:569-576.
• Nat Biotechnol; Molecular networks in context; AM Gross, T Ideker; 33; 7; 2015; 720-1; 10.1038/nbt.3283; CR2;
• Nat Methods; Network-based stratification of tumor mutations; M Hofree, JP Shen, H Carter, A Gross, T Ideker; 10; 11; 2013; 1108-15; 10.1038/nmeth.2651; CR3;
• PLoS One; Genetic association study of TNFAIP3, IFIH1, IRF5 polymorphisms with polymyositis/dermatomyositis in Chinese Han population; S Chen, Q Wang, Z Wu, Y Li, P Li, F Sun, W Zheng, Q Wu, C Wu, C Deng, F Zhang, Y Li; 9; 10; 2014; 10.1371/journal.pone.0110044; CR4;
• Cell Syst; Master regulators of infiltrate recruitment in autoimmune disease identified through network-based molecular deconvolution; JC Chen, JE Cerise, A Jabbari, R Clynes, AM Christiano; 1; 5; 2015; 326-37; 10.1016/j.cels.2015.11.001; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： 全身性硬化症 ,  線維症 ,  組織 ,  細胞 ,  調節因子