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J-GLOBAL ID：201802249212339083   整理番号：18A1711103

4種の土壌由来フェナントレン分解Acidovorax株の多相特性化とAcidovorax carolinensis sp.nov.の提案【JST・京大機械翻訳】

Polyphasic characterization of four soil-derived phenanthrene-degrading Acidovorax strains and proposal of Acidovorax carolinensis sp. nov.

著者 (7件)： Singleton David R. (Department of Environmental Sciences and Engineering, Gillings School of Global Public Health, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599-7431, USA) ,  Lee Janice (Department of Biology, University of North Carolina,Chapel Hill, NC, 27599-3280, USA) ,  Dickey Allison N. (Bioinformatics Research Center, North Carolina State University, Raleigh, NC, USA) ,  Stroud Aaron (Department of Biology, University of North Carolina,Chapel Hill, NC, 27599-3280, USA) ,  Scholl Elizabeth H. (Bioinformatics Research Center, North Carolina State University, Raleigh, NC, USA) ,  Wright Fred A. (Bioinformatics Research Center, North Carolina State University, Raleigh, NC, USA) ,  Aitken Michael D. (Department of Environmental Sciences and Engineering, Gillings School of Global Public Health, University of North Carolina, Chapel Hill, NC 27599-7431, USA)
資料名： Systematic and Applied Microbiology  (Systematic and Applied Microbiology)
巻： 41  号： 5  ページ： 460-472  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0168A  ISSN： 0723-2020  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Acidovorax属のメンバーとして同定された4つの細菌株を,米国,ノースカロライナ州の2つの地理的に異なるが類似の汚染土壌から分離し,特性化し,それらのゲノムを配列決定した。それらの16S rRNA遺伝子は,多環芳香族炭化水素(PAH)フェナントレンを有する土壌の1つの安定同位体プロービング(SIP)の間に以前に回収されたものと非常に類似していた。全ての菌株の従属栄養増殖は,フェナントレンと同様に多くの有機酸で生じたが,他の試験したPAHsはなかった。最適増殖は中温,中性pHおよび低塩分条件下で好気的に発生した。主な脂肪酸は,C_16:1ω7c/C_16:1ω6c,C_16:0,およびC_18:1ω7cであり,属と一致した。ゲノムG+C含量は63.6~64.2%の範囲であった。全ゲノム比較と生理学的分析の組合せは,これらの4つの株がAcidovorax属内の単一種を表す可能性があることを示した。フタル酸塩へのフェナントレン分解のための染色体遺伝子は,フェナントレン分解Delftia,Burkholderia,Alcaligenes,およびMassilia種における高度に保存された領域とほぼ同一であった。フェナントレン代謝のためのより低い分解経路は,記述された遺伝子と蛋白質との比較によって推論された。本研究で記述された4つの株から成る新種Acidovorax carolinensis sp. nov.を,菌株NA3~Tをタイプ株(=LMG30136,=DSM10508)として提案した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *キャラクタリゼーション ,  塩分 ,  脂肪酸 ,  芳香族縮合炭化水素 ,  タンパク質 ,  ゲノム ,  新種 ,  有機酸 ,  好気性 ,  代謝 ,  従属栄養
準シソーラス用語： 菌株 ,  16S rRNA遺伝子 ,  *アシドボラックス属 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Acidovorax ,  フェナントレン ,  多環芳香族炭化水素

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

物質索引 (1件)： フェナントレン

タイトルに関連する用語 (8件)： 土壌 ,  フェナントレン ,  分解 ,  Acidovorax ,  株 ,  多相 ,  特性化 ,  提案