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J-GLOBAL ID：201802257715810683   整理番号：18A0967193

in vitroでの筋管分化におけるゲノムの3D構成の変化と転写の間の結合【JST・京大機械翻訳】

Linkages between changes in the 3D organization of the genome and transcription during myotube differentiation in vitro

著者 (6件)： Doynova Malina D. (Liggins Insitute, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Markworth James F. (Liggins Insitute, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Cameron-Smith David (Liggins Insitute, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Vickers Mark H. (Liggins Insitute, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  O’Sullivan Justin M. (Liggins Insitute, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  O’Sullivan Justin M. (Liggins Institute, University of Auckland, Auckland, New Zealand)
資料名： Skeletal Muscle (Web)  (Skeletal Muscle (Web))
巻： 7  号： 1  ページ： 5  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7051A  ISSN： 2044-5040  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】真核生物ゲノムの空間的組織化は,細胞で起こっている根底にある核過程を容易にして,反映する。このように,ゲノムの空間組織化は,哺乳類発生に寄与する核調節過程の分析を可能にするゲノム生物学の窓を表す。【方法】本研究において,Hi-CおよびRNA-seqを用いて,シチジン類似体AraCの存在下または不在下で,筋管への分化前後のマウス筋肉前駆細胞(C2C12筋芽細胞)におけるゲノム構成およびトランスクリプトームを捕捉した。【結果】筋管と筋芽細胞ゲノムの間の高レベルの相関にもかかわらず,有意な局所的および全体的発達変化を観察した。注目すべきことに,異なる発生段階間の転写産物レベルの最大変動を示す遺伝子は,主にユークロマチン区画内にあった。HIST1遺伝子座内の複製依存性ヒストン変異体の発現に有意な再構成と変化があった。最終的に,AraCによる末端分化筋管の処理は,ピロトーシスに関与する遺伝子セットのトランスクリプトームと3Dゲノム組織化への付加的変化をもたらした。結論:これらの結果は,クロマチン構造機構を介して仲介される発生及び環境刺激に対する筋肉細胞特異的応答の証拠を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 筋細胞 ,  再構成 ,  *ゲノム ,  筋芽細胞 ,  遺伝子 ,  トランスクリプトーム ,  真核生物 ,  *in vitro実験 ,  ヒストン ,  *三次元 ,  *筋管 ,  *分化 ,  哺乳類
準シソーラス用語： 転写産物 ,  前駆細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 筋肉 ,  ゲノム構成 ,  開発 ,  HI-C ,  トランスクリプトーム

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (94件)：

• Cold Spring Harb Perspect Biol; Building muscle: molecular regulation of myogenesis; CF Bentzinger, YX Wang, MA Rudnicki; 4; 2012; a008342; 10.1101/cshperspect.a008342; CR1;
• Vertebrate myogenesis; B Brand-Saberi; Springer Berlin Heidelberg; 2015; CR2;
• Nat Rev Genet; The genetics of vertebrate myogenesis; RJ Bryson-Richardson, PD Currie; 9; 2008; 632-646; 10.1038/nrg2369; CR3;
• Curr Opin Cell Biol; Actin isoforms; IM Herman; 5; 1993; 48-55; 10.1016/S0955-0674(05)80007-9; CR4;
• J Muscle Res Cell Motil; Expression of myosin heavy chain and of myogenic regulatory factor genes in fast or slow rabbit muscle satellite cell cultures; C Barjot, M-L Cotten, C Goblet, RG Whalen, F Bacou; 16; 1995; 619-628; 10.1007/BF00130243; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： 筋管 ,  分化 ,  ゲノム ,  3D ,  転写