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J-GLOBAL ID：201802260101016672   整理番号：18A1007291

膜蛋白質のトポロジーと遊離ペプチドを明らかにするための分割ユビキチン系【JST・京大機械翻訳】

A split ubiquitin system to reveal topology and released peptides of membrane proteins

著者 (3件)： Li Qiu-Ping (Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China) ,  Wang Shuai (Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China) ,  Gou Jin-Ying (Institute of Plant Biology, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai, China)
資料名： BMC Biotechnology (Web)  (BMC Biotechnology (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 69  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7348A  ISSN： 1472-6750  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】膜蛋白質は,細胞における膜の生物学的機能を定義する。膜貫通蛋白質の細胞外ペプチドは病原体または環境からシグナルを受け取り,薬物開発の主要標的である。それらの必須の役割にもかかわらず,膜蛋白質は,それらの発現と精製における技術の困難さのために,トポロジー研究においては不明なままである。【方法】最初に,標的遺伝子を,NまたはC末端におけるC末端ユビキチンと融合する目的ベクターにクローン化する。次に,標的遺伝子とNub~WTまたはNub~Gベクターを持つCubベクターをそれぞれAP4またはAP5酵母細胞に形質転換した。交配後,二倍体細胞を選択培地に浸し,成長をチェックした。標的蛋白質のトポロジーをTable1に従って決定した。【結果】著者らは,単純酵母実験における膜蛋白質のトポロジーと切断ペプチドを研究するために,分割ユビキチントポロジー(SUT)分析システムを提示する。SUT系では,核-細胞質蛋白質と融合した転写活性化因子(TA)は,陽性および陰性対照ベクターの両方で強い自己活性化を示す。膜蛋白質の細胞質末端と融合したTaは,野生型N末端ユビキチン(Nub~WT)を有する陽性対照ベクターのみでレポーター遺伝子を活性化する。しかしながら,膜蛋白質の細胞外末端と融合したTAは,Nub~WTでもレポーター遺伝子を活性化できない。興味深いことに,膜蛋白質の放出ペプチドと融合したTAは,SUT系で自己活性化を示した。【結論】SUTシステムは,計算予測と大規模プロテオミクス技術に相補的な単純で迅速な実験手順である。SUTからの予備データは,病原体認識と新薬開発に有用である。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プロテオミクス ,  交配 ,  *ペプチド ,  膜貫通タンパク質 ,  病原体 ,  *ユビキチン ,  レポーター遺伝子 ,  野生型 ,  酵母 ,  *位相幾何学 ,  *タンパク質 ,  予測 ,  細胞質 ,  ベクター ,  形質転換

著者キーワード (5件)： 分割ユビキチン ,  膜蛋白質 ,  細胞外末端 ,  細胞質末端 ,  遊離ペプチド

分類 (3件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (25件)：

• BMC Biol; Mapping the human membrane proteome: a majority of the human membrane proteins can be classified according to function and evolutionary origin; MS Almen, KJ Nordstrom, R Fredriksson, HB Schioth; 7; 2009; 50; 10.1186/1741-7007-7-50; CR1;
• Nature; Functional rafts in cell membranes; K Simons, E Ikonen; 387; 6633; 1997; 569-572; 10.1038/42408; CR2;
• J Cell Biol; Transfer of proteins across membranes. I. Presence of proteolytically processed and unprocessed nascent immunoglobulin light chains on membrane-bound ribosomes of murine myeloma; G Blobel, B Dobberstein; 67; 3; 1975; 835-851; 10.1083/jcb.67.3.835; CR3;
• Plant Cell; Wheat stripe rust resistance protein WKS1 reduces the ability of the thylakoid-associated ascorbate peroxidase to detoxify reactive oxygen species; JY Gou, K Li, K Wu, X Wang, H Lin, D Cantu, C Uauy, A Dobon-Alonso, T Midorikawa, K Inoue; 27; 6; 2015; 1755-1770; 10.1105/tpc.114.134296; CR4;
• Plant Methods; A rapid and cost-effective fluorescence detection in tube (FDIT) method to analyze protein phosphorylation; X Jin, JY Gou; 12; 2016; 43; 10.1186/s13007-016-0143-5; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： 膜蛋白質 ,  トポロジー ,  ペプチド ,  ユビキチン