文献

J-GLOBAL ID：201802260200286872   整理番号：18A0976288

入院癌患者における口腔および腸ミクロビオーム時間変動の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of oral and gut microbiome temporal variability in hospitalized cancer patients

著者 (13件)： Galloway-Pena Jessica R. (Department of Infectious Disease, Infection Control and Employee Health, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Smith Daniel P. (The Alkek Center for Metagenomics and Microbiome Research, Department of Molecular Virology and Microbiology, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Sahasrabhojane Pranoti (Department of Infectious Disease, Infection Control and Employee Health, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Wadsworth W. Duncan (Department of Statistics, Rice University, Houston, USA) ,  Fellman Bryan M. (Department of Biostatistics, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Ajami Nadim J. (The Alkek Center for Metagenomics and Microbiome Research, Department of Molecular Virology and Microbiology, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Shpall Elizabeth J. (Department of Stem Cell Transplantation, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Daver Naval (Department of Leukemia, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Guindani Michele (Department of Statistics, University of California, Irvine, USA) ,  Petrosino Joseph F. (The Alkek Center for Metagenomics and Microbiome Research, Department of Molecular Virology and Microbiology, Baylor College of Medicine, Houston, USA) ,  Kontoyiannis Dimitrios P. (Department of Infectious Disease, Infection Control and Employee Health, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Shelburne Samuel A. (Department of Infectious Disease, Infection Control and Employee Health, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA) ,  Shelburne Samuel A. (Department of Genomic Medicine, MD Anderson Cancer Center, Houston, USA)
資料名： Genome Medicine (Web)  (Genome Medicine (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 21  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7320A  ISSN： 1756-994X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】悪い患者におけるミクロビオームの自立的な縦方向の可変性は,マイクロバイオベースの測定と治療を臨床診療に移動させるために重要である。しかし,微生物の安定性に関するデータの大部分は健常者から得られている。ここでは,患者内の時間的微生物相変動性,そのような変動性を駆動する因子,および化学療法中の入院癌患者の広範な長期コホートにおけるその臨床的影響を決定することを試みた。【方法】誘導化学療法(IC)を受けている急性骨髄性白血病(AML)患者59名の糞便(n=365)および経口(n=483)サンプルを,好中球回収までの化学療法の開始から採取した。16S rRNA遺伝子配列解析により,微生物学的特性化を行った。時間的変動性は,シャノン多様性指数(SDI)の変動係数(CV)と患者当たりの非加重および加重Unifrac距離を用いて決定した。患者内の時間的変動性と患者の安定性カテゴリーの測定を,属の豊度との相関のために分析した。患者の群を分析して,有害転帰を有する患者が有意に異なるレベルの微小生物学的時間的変動性を有するかどうかを測定した。微生物の時間的不安定性の潜在的臨床運転者を,多変量回帰分析を用いて決定した。【結果】著者らのコホートは,SDI CVに基づく糞便および経口微生物多様性の高い程度の患者内の時間的不安定性を証明した。著者らは,異なるレベルの微生物相の時間安定性を持つ個体間の複数の分類群の相対存在量の統計的に有意な差を同定した。経口SDIの患者内時間的変動の増加は,IC中の感染リスクの増加と相関し(P=0.02),より高い糞便SDI CVsは,IC後90日の感染リスクの増加と相関した(P=0.04)。抗生物質の総日は,経口微生物多様性(P=0.03)と群集構造(P=0.002)の両方の時間的変動性の増加と有意に関連した。結論:これらのデータはAML患者における経口および腸の微生物相の縦方向の変動性を定量化し,増加した変動性が有害な臨床転帰と相関していることを示し,焦点を当てたマイクロバイオーム修復の方法として安定化分類群を使用する可能性を提供する。さらに,これらの結果は,研究と将来の臨床診療において,1回の時間測定よりもむしろ,縦型マイクロバイオーム試料採取と分析の重要性を支持する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 母集団 ,  *入院 ,  ミクロフローラ ,  *キャラクタリゼーション ,  抗生物質 ,  *経時変化 ,  微生物 ,  遺伝子 ,  *患者 ,  不安定性 ,  薬物療法 ,  多重回帰分析
準シソーラス用語： 分類群 ,  微生物多様性 ,  *癌患者 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ミクロビオーム ,  時間的変動性 ,  白血病 ,  化学療法 ,  抗生物質

分類 (2件)： 微生物の生態  (EG03040J) ,  腫ようの薬物療法  (GE03032C)

引用文献 (47件)：

• Cameron SJ, Huws SA, Hegarty MJ, Smith DP, Mur LA. The human salivary microbiome exhibits temporal stability in bacterial diversity. FEMS Microbiol Ecol. 2015;91(9):fiv091.
• Proc Natl Acad Sci U S A.; Composition, variability, and temporal stability of the intestinal microbiota of the elderly; MJ Claesson, S Cusack, O O’Sullivan, R Greene-Diniz, H Weerd, E Flannery; 108; Suppl 1; 2011; 4586-4591; 10.1073/pnas.1000097107; CR2;
• Science; Bacterial community variation in human body habitats across space and time; EK Costello, CL Lauber, M Hamady, N Fierer, JI Gordon, R Knight; 326; 5960; 2009; 1694-1697; 10.1126/science.1177486; CR3;
• Cell; Temporal stability of the human skin microbiome; J Oh, AL Byrd, M Park, NCS Program, HH Kong, JA Segre; 165; 4; 2016; 854-866; 10.1016/j.cell.2016.04.008; CR4;
• Trends Microbiol; Functional redundancy-induced stability of gut microbiota subjected to disturbance; A Moya, M Ferrer; 24; 5; 2016; 402-413; 10.1016/j.tim.2016.02.002; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 入院 ,  癌患者 ,  口腔 ,  腸 ,  ミクロビオーム ,  時間変動 ,  特性化