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J-GLOBAL ID：201802261138459802   整理番号：18A1530596

秦川肉牛のCGI-58遺伝子のSNP部位と肉質とそのプロモーター活性の関係【JST・京大機械翻訳】

Relationship between CGI-58 gene single-nucleotide polymorphism of Qinchuan beef cattle and meat quality and promoter activity

著者 (6件)： Wang Xiaoyu (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌,712100) ,  Li Anning (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌,712100) ,  Gui Linsheng (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌,712100) ,  Sayed Haidar Abbas Raza (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌,712100) ,  Wu Sen (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌,712100) ,  Zan Linsen (西北農林科技大学動物科技学院,陜西楊凌712100;国家肉牛改良中心,陜西楊凌712100;現代牛業生物技術与応用国家地方聯合工程研究中心,陜西楊凌712100;陜西省肉牛工程技術研究中心,陜西楊凌712100)
資料名： Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban)  (Xibei Nonglin Keji Daxue Xuebao(Zirankexueban))
巻： 46  号： 4  ページ： 13-19,27  発行年： 2018年 
JST資料番号： C5021A  ISSN： 1671-9387  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]秦川肉牛のCGI-58遺伝子の5’-調節領域の中の1つの新しい一塩基多型(singlenucleotidepolymorphism)を研究する。SNP部位と肉品質の関連性、及びその遺伝子プロモーター活性に対する影響。[方法]1824月齢の480頭の秦川肉牛を研究対象とし、その筋肉内脂肪含有量、眼筋面積と背脂肪厚などの肉品質性状指標を測定した。頚静脈からのウシ血液サンプルを採取し,DNAサンプルを抽出し,PCRによりCGI-58遺伝子の5’-調節領域を増幅し,直接配列決定法によりその一塩基多型を検出した。SAS(version8.1)ソフトウェアによって提供された一般線形モデル(GLM)を用いて,一塩基多型(SNP)と肉質形質の間の相関を分析した。CGI-58遺伝子の潜在的転写因子結合部位とそのメチル化レベルを,MatInspectorとcMethPrimerソフトウェアによって分析した。SNP部位の異なる遺伝子型を含む二重ルシフェラーゼレポーターベクターを構築し,マウス3T3L-1,C2C12細胞株およびウシ前駆細胞にトランスフェクトした。3種類の細胞中のルシフェラーゼの相対活性を測定し、統計学的分析を行った。[結果]秦川肉牛のCGI-58遺伝子の5’-調節区に1つの新しいSNP部位を発見した。g.14451079A>C.g.14451079A>Cの3つの遺伝子型があった。AA、CCとACはAA遺伝子型の頻度が最も高く、A対立遺伝子の頻度がC対立遺伝子の頻度より大きく、AC遺伝子型のプロモーター活性と眼筋面積がその他の遺伝子型より顕著に高かった。g.14451079A>CはAからCまでの突然変異がCGI-58プロモーター領域の1つの予測転写因子結合部位v-mybの第2の塩基Aに起こった。この突然変異はプロモーター活性に顕著な変化をもたらし、この転写因子結合部位はソフトウェア分析のCpG島に位置している。[結論]秦川肉牛のCGI-58遺伝子プロモーター領域のg.14451079A>C部位の一塩基多型は眼筋面積と有意な相関があった。また,この遺伝子プロモーターの活性には顕著な影響があった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  遺伝子型 ,  対立遺伝子 ,  *肉牛 ,  ソフトウェア ,  プロモーター領域 ,  メチル化 ,  突然変異 ,  一塩基多型 ,  *河川 ,  *遺伝子 ,  統計解析 ,  ルシフェラーゼ ,  ベクター ,  品質

著者キーワード (5件)： CGI-58 gene ,  Qinchuan beef cattle ,  promoter activity ,  meat quality ,  v-myb

分類 (2件)： 牛  (FD02020Y) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 秦 ,  肉牛 ,  遺伝子 ,  SNP ,  肉質 ,  プロモーター活性