文献

J-GLOBAL ID：201802262485385583   整理番号：18A0965560

ゲノム進化動力学は,Sesamum indicumゲノムの複雑性を説明する【JST・京大機械翻訳】

Genome evolutionary dynamics followed by diversifying selection explains the complexity of the Sesamum indicum genome

著者 (7件)： Yu Jingyin (The Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute, the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Wuhan, China) ,  Wang Linhai (The Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute, the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Wuhan, China) ,  Guo Hui (Plant Genome Mapping Laboratory, the University of Georgia, Athens, USA) ,  Liao Boshou (The Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute, the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Wuhan, China) ,  King Graham (Southern Cross Plant Science, Southern Cross University, Lismore, Australia) ,  King Graham (The Key Laboratory of Crop Genetic Improvement, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China) ,  Zhang Xiurong (The Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Oil Crops, Ministry of Agriculture, Oil Crops Research Institute, the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Wuhan, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 257  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】正孔ゲノム重複(WGD)とタンデム重複(TD)は,ゲノム複雑性と進化的新規性のための生の遺伝的材料の2つの重要な供給源を提供する。古二倍体Vitis viniferaによる共通祖先から分岐した後のSesamum indicumゲノムの複雑性についてはほとんど知られておらず,さらにWGDとTDイベントを経験した。【結果】著者らは,現代のS.indicumゲノムを形成する過程の間に作用している進化的動力学の多重層を発見するために,祖先イベントからの異なるクラスの相互およびゲノム内遺伝子対の機能的相違を分析した。包括的なゲノム間分析により,S.indicumの2つのサブゲノムの間には,V.viniferaと比較して60%および70%のsyntenオーソログ遺伝子対が保持されていたが,選択圧力下では有意差はなかった。ゲノム内解析のために,5932の重複遺伝子対が分別を経験し,残りの1,236重複遺伝子対が多様化選択下で機能的分岐を受けた。TDイベントの解析により,2-16遺伝子の1,089タンデム配列からの2,945パラロガス遺伝子対が多様化選択下で機能的分岐を経験することを示した。異なるクラスの遺伝子対の配列多様化により,ほとんどのTDイベントがWGDイベント後に生じ,他のものはWGDイベントに先立って古代のTDイベントを示す祖先遺伝子秩序に従うことを明らかにした。異なるクラスの遺伝子対に対する著者らの機能解析は,WGDとTD進化イベントが,個々の植物の耐久性を維持しながら,新しい相補的機能性の探索を可能にする遺伝子導入の両方に関与していることを示した。結論:本研究では,最初に,S.indicumにおける各進化イベントに関連する動的過程を特性化するために,異なるクラスの遺伝子対の機能的相違を調べた。データは,異なるクラスの遺伝子対の間で大規模で明確な機能的相違を示し,S.indicumゲノムの複雑性を説明する遺伝子機能多様化のゲノム規模の見解を提供した。これは植物種形成の機構を研究するための生物学的モデルを提供し,特に開花植物の進化史の文脈において,被子植物ゲノムの研究に対する新しい洞察を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多様化 ,  遺伝子重複 ,  遺伝子 ,  遺伝子導入 ,  遺伝 ,  機能分析 ,  *ゲノム ,  キャラクタリゼーション ,  被子植物 ,  開花 ,  二倍体 ,  生体モデル
準シソーラス用語： 遺伝子機能 ,  オルソログ遺伝子 ,  *複雑性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ゲノム進化 ,  動力学 ,  全ゲノム重複 ,  タンデム重複 ,  関数発散

分類 (1件)： 進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (48件)：

• Adv Genet; Possible significances of duplication in evolution; SG Stephens; 4; 1951; 247-265; CR1;
• Nature; Unravelling angiosperm genome evolution by phylogenetic analysis of chromosomal duplication events; JE Bowers, BA Chapman, J Rong, AH Paterson; 422; 6930; 2003; 433-438; 10.1038/nature01521; CR2;
• Plant Cell; Widespread paleopolyploidy in model plant species inferred from age distributions of duplicate genes; G Blanc, KH Wolfe; 16; 7; 2004; 1667-1678; 10.1105/tpc.021345; CR3;
• Nature; Ancestral polyploidy in seed plants and angiosperms; Y Jiao, NJ Wickett, S Ayyampalayam, AS Chanderbali, L Landherr, PE Ralph, LP Tomsho, Y Hu, H Liang, PS Soltis; 473; 7345; 2011; 97-100; 10.1038/nature09916; CR4;
• Nature; Genome sequence of the palaeopolyploid soybean; J Schmutz, SB Cannon, J Schlueter, J Ma, T Mitros, W Nelson, DL Hyten, Q Song, JJ Thelen, J Cheng; 463; 7278; 2010; 178-183; 10.1038/nature08670; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： ゲノム進化 ,  動力学 ,  Sesamum ,  ゲノム ,  複雑性 ,  説明