細菌性多剤エクスポーターAcrBにおける巻上げループはサブドメインの大きい運動を可能にする高度に柔軟なヒンジである【JST・京大機械翻訳】

Zwama Martijn; Zwama Martijn; Zwama Martijn; Hayashi Katsuhiko; Hayashi Katsuhiko; Sakurai Keisuke; Nakashima Ryosuke; Kitagawa Kimie; Nishino Kunihiko; Yamaguchi Akihito

文献

J-GLOBAL ID：201802264861834061 整理番号：18A0787862

細菌性多剤エクスポーターAcrBにおける巻上げループはサブドメインの大きい運動を可能にする高度に柔軟なヒンジである【JST・京大機械翻訳】

Hoisting-Loop in Bacterial Multidrug Exporter AcrB Is a Highly Flexible Hinge That Enables the Large Motion of the Subdomains

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資料名：
巻： 8 ページ： 2095 発行年： 2017年
JST資料番号： U7080A ISSN： 1664-302X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

RND型輸出者の過剰発現は,グラム陰性病原体における多剤耐性(MDR)の主要原因の1つである。大腸菌の主要排出ポンプAcrBのようなRND輸送体において,薬物排出は輸送体ドメインにおいて起こるが,プロトンは膜貫通ドメインを通して流れる。膜貫通ヘリックス(TM8)とサブドメインPC2の境界において,ランダムコイルからαヘリックスへの変化により巻上げ運動をするループがあり,薬物チャンネル入口を開き閉鎖する。このループは膜貫通とポートドメイン間のアロステリック立体配座結合に重要な役割を果たしていると考えられる。ここでは,AcrBの一連の柔軟性ループ変異体の結果を示した。機能的輸送体である3つのアミノ酸切断ループ変異体の結晶構造を決定し,Cβ15とループの間の短いα-ヘリックスがアクセス及び結合単量体においてランダムコイルに,そして押出単量体において部分的に伸長したコイルからヘリックスへの変化をもたらすことを示した。ループは代償的な立体配座変化を受け,チャンネルの開口と閉鎖を容易にした。さらに,より柔軟な変異ループ(プロリン変異および有意に伸長)は,輸出中に依然として機能することができる。しかしながら,この領域における柔軟性は限られており,さらに切断された変異体(6アミノ酸欠失)はほとんど不活性になる。著者らは,巻上げループが,立体配座エネルギー伝達を受動的に可能にする非常に柔軟なヒンジであることを見出した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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細胞膜の輸送 , 分子構造

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