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J-GLOBAL ID：201802265450353287   整理番号：18A1800325

ヘビ毒ホスホリパーゼB様酵素がNTNヒドロラーゼであることを示すモデル化と分子動力学【JST・京大機械翻訳】

Modeling and molecular dynamics indicate that snake venom phospholipase B-like enzymes are Ntn-hydrolases

著者 (5件)： Coronado Monika Aparecida (Multiuser Center for Biomolecular Innovation, Department of Physics, Universidade Estadual Paulista, UNESP/Ibilce, Sao Jose do Rio Preto, SP, Brazil) ,  da Silva Olivier Danilo (Multiuser Center for Biomolecular Innovation, Department of Physics, Universidade Estadual Paulista, UNESP/Ibilce, Sao Jose do Rio Preto, SP, Brazil) ,  Eberle Raphael Josef (Multiuser Center for Biomolecular Innovation, Department of Physics, Universidade Estadual Paulista, UNESP/Ibilce, Sao Jose do Rio Preto, SP, Brazil) ,  do Amaral Marcos Serrou (Institute of Physics, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, MS, Brazil) ,  Arni Raghuvir Krishnaswamy (Multiuser Center for Biomolecular Innovation, Department of Physics, Universidade Estadual Paulista, UNESP/Ibilce, Sao Jose do Rio Preto, SP, Brazil)
資料名： Toxicon  (Toxicon)
巻： 153  ページ： 106-113  発行年： 2018年 
JST資料番号： C0339B  ISSN： 0041-0101  CODEN： TOXIA6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 文献レビュー  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホスホリパーゼB様(SVPLB様)酵素は多くの毒液中に比較的少量存在するが,それらの生物学的機能と作用機序は明らかではない。ウシNtn-加水分解酵素の結晶構造に基づく相同性モデリングにより,Crotalus adamanteusからのSVPLB様酵素の三次元モデルを作成し,モデル化蛋白質はNtnヒドロラーゼの保存ドメイン特性を有した。分子動力学シミュレーションは,自己触媒開裂による活性化が活性部位への接近性を増加させる25アミノ酸の除去をもたらすことを示した。SVPLB様酵素は高反応性システインを有し,従ってN末端求核試薬(Ntn)ヒドロラーゼファミリーに属するアミダーゼである。Ntn-ヒドロラーゼ(N末端求核試薬)は自己触媒的に活性化される多様な酵素のスーパーファミリーを形成する;N末端触媒求核試薬はアミド結合の開裂に関与する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *モデリング ,  *酵素 ,  ガラガラヘビ属 ,  *ヒドロラーゼ ,  結晶構造 ,  活性部位 ,  アミダーゼ ,  *分子動力学 ,  タンパク質 ,  生物活性 ,  求核試薬 ,  相同性 ,  *蛇毒
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション ,  ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ヘビ毒ホスホリパーゼB ,  Crotalus adamanteus ,  NTNヒドロラーゼ ,  分子モデリング ,  分子動力学

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヘビ毒 ,  ホスホリパーゼB ,  酵素 ,  ヒドロラーゼ ,  モデル ,  分子動力学