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J-GLOBAL ID：201802271380396625   整理番号：18A0965757

RAD配列決定によるダイズrils個体群における収量関連および2つの品質形質の高密度遺伝地図およびQTLマッピングの構築【JST・京大機械翻訳】

Construction of high-density genetic map and QTL mapping of yield-related and two quality traits in soybean RILs population by RAD-sequencing

著者 (30件)： Liu Nianxi (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Liu Nianxi (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Liu Nianxi (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Liu Nianxi (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Li Mu (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Li Mu (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Li Mu (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Li Mu (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Hu Xiangbao (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Hu Xiangbao (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Hu Xiangbao (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Hu Xiangbao (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Ma Qibin (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Ma Qibin (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Ma Qibin (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Ma Qibin (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Mu Yinghui (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Mu Yinghui (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Mu Yinghui (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Mu Yinghui (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Tan Zhiyuan (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Tan Zhiyuan (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Tan Zhiyuan (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Tan Zhiyuan (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Xia Qiuju (Beijing Genome Institute (BGI), Shenzhen, People’s Republic of China) ,  Zhang Gengyun (Beijing Genome Institute (BGI), Shenzhen, People’s Republic of China) ,  Nian Hai (The State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-Bioresources, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Nian Hai (The Key Laboratory of Plant Molecular Breeding, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Nian Hai (The Guangdong Subcenter of the National Center for Soybean Improvement, College of Agriculture, South China Agricultural University, Guangzhou, People’s Republic of China) ,  Nian Hai (Joint Laboratory of Plant Breeding, South China Agricultural University-ShanDong Shofine Seed Technology Co. Ltd, Guangzhou, People’s Republic of China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 466  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ダイズ育種の過剰な目標の1つは,改良された品質特性を有する収量を増加させる系統を開発することである。高密度マーカーQTLマッピングは,作物改良を容易にするための新しいゲノム情報を同定するための有効な戦略として役立つ。本研究において,制限部位関連DNA配列決定(RAD-Seq)アプローチを用いて,組換え近交系(RIL)個体群(Zhonghuang 24×Huaxia 3)を遺伝子型決定した。高密度ダイズ遺伝子地図を構築し,6つの収量関連および2つの品質形質に影響を及ぼすことが示されたいくつかのQTLを同定するために用いた。【結果】合計47,472の単一ヌクレオチド多型(SNP)を,隣接マーカー間の平均距離1.00cmで,2639組換えビン単位に統合されたRILsに対して検出した。収量関連形質に対する47のQTLと穀粒品質形質に対する13のQTLは,2年間の研究において16の染色体上に分布していることが見出された。それらの間で,18のQTLは安定で,両方の分析において同定された。26のQTLは,表現型変異の32.56%を説明する56kb領域における単一QTL(qN19a)により初めて同定され,これらのうち10は新規で安定なQTLであった。さらに,4つの異なる染色体上の8QTLホットポットを相関形質に対して同定した。【結論】RAD配列決定により,収量関連および品質形質のためのいくつかの新しいQTLおよび重要なQTLクラスタを,新しい高密度ビン連鎖地図に基づいて同定した。3つの予測された遺伝子は,ダイズの収量と品質の両方に直接的または間接的な影響を持つ可能性のある候補として選択された。著者らの知見は,共局在形質の一般的な遺伝的制御機構の理解と,ダイズの収量と品質を同時に調節するための更なる分析のための栽培品種の選択に役立つであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝的調節 ,  育種 ,  *遺伝子地図 ,  連鎖地図 ,  一塩基多型 ,  *ダイズ ,  栽培品種 ,  *個体群 ,  染色体 ,  遺伝子 ,  *品質
準シソーラス用語： 表現型変異 ,  組換近交系 ,  *QTL解析 ,  *高密度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： QTL ,  収量関連形質 ,  品質特性 ,  RADシークエンシング ,  ダイズ

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (64件)：

• Theor Appl Genet; QTL for seed protein and amino acids in the Benning × Danbaekkong soybean population; CV Warrington, H Abdel-Haleem, DL Hyten, PB Cregan, JH Orf, AS Killam; 128; 5; 2015; 839-850; 10.1007/s00122-015-2474-4; CR1;
• Mol Breed; Identification and mapping of stable QTL for protein content in soybean seeds; J Wang, P Chen, D Wang, G Shannon, A Zeng, M Orazaly; 35; 3; 2015; 1-10; 10.1007/s11032-015-0285-6; CR2;
• Crop Sci; Genetic mapping and confirmation of quantitative trait loci for seed protein and oil contents and seed weight in soybean; SM Pathan, T Vuong, K Clark, JD Lee, JG Shannon, CA Roberts; 53; 3; 2013; 765-774; 10.2135/cropsci2012.03.0153; CR3;
• Mol Biol Evol; Identification of restriction-fragment-length polymorphisms in genomic DNA of the lesser snow goose (Anser caerulescens Caerulescens); TW Quinn, BN White; 4; 2; 1987; 126-143; CR4;
• Genomics; Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification; E Zietkiewicz, A Rafalski, D Labuda; 20; 2; 1994; 176-183; 10.1006/geno.1994.1151; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： ダイズ ,  個体群 ,  収量 ,  形質 ,  高密度 ,  遺伝地図 ,  QTLマッピング ,  構築