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J-GLOBAL ID：201802273091586591   整理番号：18A1260919

マルチドメイン蛋白質の機械的変性経路の解明:ホスホグリセリン酸キナーゼ【JST・京大機械翻訳】

Unraveling the Mechanical Unfolding Pathways of a Multidomain Protein: Phosphoglycerate Kinase

著者 (3件)： Li Qing (Center for Biologically Inspired Materials and Material Systems, Department of Mechanical Engineering and Materials Science, Pratt School of Engineering, Duke University, Durham, North Carolina) ,  Scholl Zackary N. (Program in Computational Biology and Bioinformatics, Department of Mechanical Engineering and Materials Science, Pratt School of Engineering, Duke University, Durham, North Carolina) ,  Marszalek Piotr E. (Center for Biologically Inspired Materials and Material Systems, Department of Mechanical Engineering and Materials Science, Pratt School of Engineering, Duke University, Durham, North Carolina)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 115  号： 1  ページ： 46-58  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)は解糖に重要な高度に保存された酵素である。PGKは2つの類似ドメインから成る単量体蛋白質であり,天然状態及び折畳み時のドメイン間相互作用を研究するための多くの研究の焦点であった。以前の研究では,単一分子の非折畳みと再折畳みの間の安定性または構造の過渡的変化を観察することを困難にした,分子の大きな集合体上のシグナルを測定するために,従来の生物物理学的方法(円偏光二色性,トリプトファン蛍光およびNMR)を用いた。ここでは,原子間力分光法を用いてPGKの単一分子を折畳み,その非折畳み過程におけるPGKの立体配座動力学を調べるために分子動力学計算機シミュレーションを行った。結果は,そのドメインの初期強制分離後,酵母PGK(yPGK)が単一の機械的変性経路に従わないことを示した。その代わりに,それは2つの異なる経路,すなわちN末端ドメインからの非折畳みまたはC末端ドメインからの非折畳みに従う。切断されたyPGK N末端ドメインは一時的中間体を介して折畳まれたが,構造的に類似したC末端ドメインはその機械的変性過程を通して検出可能な中間体を持たなかった。完全長yPGKのN末端ドメインは時間の13%の強い非折畳み中間体を示し,一方,短縮ドメイン(yPGKNT)は時間の81%を通して遷移した。この効果は,yPGKの機械的性質がその成分の機械的性質から簡単に推定できないことを示している。大腸菌PGKはyPGKと比較して機械的に安定性が低いことも見出した。著者らの結果は,マルチドメイン蛋白質の折畳み挙動が分離ドメインの研究のみに基づいて予測するのが困難であるという観察の成長体を支持する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酵母 ,  計算機シミュレーション ,  折畳み ,  分子動力学 ,  機械的性質 ,  円偏光二色性 ,  中間体 ,  単量体 ,  デコンボリューション ,  大腸菌 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  *タンパク質 ,  立体配座
準シソーラス用語： 単一分子 ,  *ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： マルチドメイン ,  蛋白質 ,  変性 ,  経路 ,  ホスホグリセリン酸キナーゼ