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J-GLOBAL ID：201802274076239725   整理番号：18A1141576

疾患COMPASS-オントロジーとリンクしたデータ技術に基づく疾患知識のためのナビゲーションシステム【JST・京大機械翻訳】

Disease Compass- a navigation system for disease knowledge based on ontology and linked data techniques

著者 (5件)： Kozaki Kouji (The Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University, Ibaraki, Japan) ,  Yamagata Yuki (National Institute of Biomedical Innovation, Health and Nutrition, Ibaraki, Japan) ,  Mizoguchi Riichiro (Research Center for Service Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology, Nomi, Japan) ,  Imai Takeshi (Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, Tokyo, Japan) ,  Ohe Kazuhiko (Graduate School of Medicine, The University of Tokyo, Tokyo, Japan)
資料名： Journal of Biomedical Semantics (Web)  (Journal of Biomedical Semantics (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 22  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7401A  ISSN： 2041-1480  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:医療オントロジーは,かなりの量のデータを蓄積する医療情報資源の効果的な使用に貢献すると期待される。本研究では,疾患の複雑な機構が様々な医学領域を横切る概念に関連するので,疾患オントロジーに焦点を当てた。異常状態の原因連鎖として疾患を捉える疾患の河川流モデル(RFM)を開発した。それは疾患の原因,疾患進行,および疾患の下流の結果を表し,それは医療専門家の直感に適合する。本論文では,疾患オントロジーに基づく疾患の因果連鎖のための事実リポジトリについて議論する。それは,高度な医療情報システムのための貴重な知識ベースである。【方法】著者らは,著者らの疾患オントロジーと異常オントロジーに基づく疾患の因果連鎖のための事実リポジトリを開発した。このセクションはこれら2つのオントロジーを要約する。情報科学者が,病気の因果連鎖のための資源記述フレームワーク(RDF)モデルを通して,SPARQL質問を用いてそれにアクセスすることができるように,リンクデータとして開発される。【結果】RFMのオントロジー定義に基づいて,実際のリポジトリに対するRFMの実装としてRDFモデルを設計した。疾患オントロジーから抽出された6つの主要な臨床領域における1554の疾患と7080の異常状態を,SPARQLエンドポイント(アクセス可能なAPI)によるリンクデータ(RDF)として発表する。さらに,疾患知識のナビゲーションシステムである疾患コンパスを開発した。疾患コンパスは,疾患の因果連鎖をブラウジングすることができ,異常状態を含む関連情報を得ることができる。2つのWebサービスを通して,DBpediaや3D解剖学的画像のようなリンクデータから一般的な情報を提供する。結論:疾患コンパスは,疾患の臨床医の理解に適合するような方法で,疾患関連プロセスの完全な画像を提供することができる。したがって,それは,様々なソースからの適切な情報へのアクセスによって,病気知識のユーザ調査をサポートする。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *オントロジー ,  ブラウジング ,  解剖学 ,  情報科学 ,  利用調査 ,  リポジトリ ,  医療従事者 ,  画像 ,  医用情報処理システム ,  三次元 ,  Webサービス
準シソーラス用語： 臨床医 ,  情報へのアクセス ,  SPARQL ,  情報資源 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 疾患オントロジー ,  疾患の定義 ,  病気の河川流モデル ,  リンクしたデータ ,  ナビゲーションシステム

分類 (1件)： 人工知能  (JE08000Z)

引用文献 (24件)：

• Toward an ontological treatment of disease and diagnosis; RH Scheuermann, W Ceusters, B Smith; Proc. of the 2009 AMIA Summit on Translational Bioinformatics; 2009; CR1;
• BMC Genomics; Annotating the human genome with Disease Ontology; JD Osborne; 10; 1; 2009; S6; 10.1186/1471-2164-10-S1-S6; CR2;
• Cowell LG, Smith B. Infectious Disease Ontology, Infectious Disease Informatics, Chapter 19, Sintchenko V. 2010:373-395.
• Mizoguchi R, Kozaki K, Kou H, Yamagata Y, Imai T, Waki K, Ohe K, River flow model of diseases. Proc. of the 2nd International Conference on Biomedical Ontology (ICBO2011), Buffalo, NY, USA, July, 26-30, 2011, CEUR Workshop Proceedings. 2011;833:63-70.
• Appl Ontol; Causality and the ontology of disease; RJ Rovetto, R Mizoguchi; 10; 2; 2015; 79-105; 10.3233/AO-150147; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： 疾患 ,  COMPASS ,  オントロジー ,  リンク ,  知識 ,  ナビゲーションシステム