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J-GLOBAL ID：201802277801545188   整理番号：18A0356261

日本のブタで検出されたブタアストロウイルスの全ゲノム解析は遺伝的多様性と可能な遺伝型内組換えを明らかにする【Powered by NICT】

Whole genome analysis of porcine astroviruses detected in Japanese pigs reveals genetic diversity and possible intra-genotypic recombination

著者 (24件)： Ito Mika (Ishikawa Nanbu Livestock Hygiene Service Center, Kanazawa, Ishikawa 920-3101, Japan) ,  Kuroda Moegi (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Masuda Tsuneyuki (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Akagami Masataka (Kenhoku Livestock Hygiene Service Center, Mito, Ibaraki 310-0002, Japan) ,  Haga Kei (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Haga Kei (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Tsuchiaka Shinobu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Kishimoto Mai (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Naoi Yuki (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Sano Kaori (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Omatsu Tsutomu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Yukie (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oba Mami (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Aoki Hiroshi (Faculty of Veterinary Science, Nippon Veterinary and Life Science University, Musashino, Tokyo 180-8602, Japan) ,  Ichimaru Toru (Department of Health and Medical Sciences, Ishikawa Prefectural Nursing University, Kahoku, Ishikawa, 929-1210, Japan) ,  Mukono Itsuro (Ishikawa Nanbu Livestock Hygiene Service Center, Kanazawa, Ishikawa 920-3101, Japan) ,  Ouchi Yoshinao (Kenhoku Livestock Hygiene Service Center, Mito, Ibaraki 310-0002, Japan) ,  Yamasato Hiroshi (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Shirai Junsuke (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Mizutani Tetsuya (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Nagai Makoto (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Nagai Makoto (Department of Bioproduction Science, Ishikawa Prefectural University, Nonoichi, Ishikawa 921-8836, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 50  ページ： 38-48  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ブタアストロウイルス(PoAstVs)は,世界中のいくつかの国で分布していることがブタのユビキタス腸内ウイルスである。PoAstVsは見かけ健康なブタで検出されるので,感染の臨床的意義は不明である。AstVsは最近動物における重篤な神経学的障害と関連し,ヒトを含むし,人畜共通感染能を示唆した。今日まで,日本のブタ集団におけるPoAstVsの疫学についてはほとんど知られていない。本報告では,日本のブタの糞便中のメタゲノミクスアプローチにより検出された36PoAstVsのほぼ完全なゲノムの解析を提示した。系統発生解析とペアワイズ配列比較に基づいて,10 5 15,および6配列はPoAstV2,PoAstV3,PoAstV4,PoAstV5として分類した。二または三株との混合感染は八頭のブタからの個々の糞便試料で見出された。PoAstV2とPoAstV4のOR F1a,OR F1b,ORF2の系統樹は,トポロジーの違いを示した。PoAstV3とPoAstV5株はすべてのORFの各遺伝子型内の高い配列同一性を共有していた;が,1PoAstV3歪と1PoAstV5株はORF2でそれぞれ他PoAstV3とPoAstV5株からかなりの配列発散を示した。全ゲノムを用いて再結合分析はPoAstV2とPoAstV4における複数の可能な内遺伝子型組換え事象の証拠を明らかにした,組換えは遺伝的多様性に寄与し,日本PoAstVsの進化に重要な役割を果たしていることを示唆した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 系統樹 ,  感染 ,  系統発生 ,  エンテロウイルス ,  *遺伝子型 ,  ヒト ,  位相幾何学 ,  *ゲノム ,  疫学 ,  重感染 ,  *日本 ,  配列相同性 ,  *ママストロウイルス ,  *遺伝多様性 ,  *全ゲノム解析 ,  微生物 ,  動物ウイルス

著者キーワード (5件)： アストロウイルス ,  遺伝子 ,  日本 ,  ブタ糞便 ,  組換え事象

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

タイトルに関連する用語 (6件)： 日本 ,  ブタ ,  全ゲノム解析 ,  遺伝的多様性 ,  遺伝型 ,  組換え