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J-GLOBAL ID：201802278646835471   整理番号：18A0976299

100万人のヒト癌ゲノムの分析は腫瘍変異負荷の景観を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Analysis of 100,000 human cancer genomes reveals the landscape of tumor mutational burden

著者 (25件)： Chalmers Zachary R. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Connelly Caitlin F. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Fabrizio David (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Gay Laurie (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Ali Siraj M. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Ennis Riley (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Schrock Alexa (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Campbell Brittany (The Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Shlien Adam (The Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Chmielecki Juliann (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Huang Franklin (Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, USA) ,  He Yuting (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Sun James (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Tabori Uri (The Hospital for Sick Children, Toronto, Canada) ,  Kennedy Mark (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Lieber Daniel S. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Roels Steven (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  White Jared (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Otto Geoffrey A. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Ross Jeffrey S. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Garraway Levi (Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, USA) ,  Garraway Levi (Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, USA) ,  Miller Vincent A. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Stephens Phillip J. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA) ,  Frampton Garrett M. (Foundation Medicine Inc., Cambridge, USA)
資料名： Genome Medicine (Web)  (Genome Medicine (Web))
巻： 9  号： 1  ページ： 34  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7320A  ISSN： 1756-994X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:高腫瘍変異負荷(TMB)は,免疫チェックポイント阻害剤に対する感受性の新しいバイオマーカーであり,免疫組織化学(IHC)により測定されるように,PD-1またはPD-L1発現よりPD-1およびPD-L1遮断免疫療法に対する反応とより有意に関連することが示されている。TMBの分布と高いTMBを有する患者のサブセットは,大部分の癌型においてよく特性化されていない。【方法】本研究において,標的化包括的ゲノムプロファイリング(CGP)アッセイにより測定したTMBを,exome配列決定により測定したTMBと比較し,全エキソソームより少ない配列決定時のTMBにおける予想される分散をシミュレートした。次に,10万の癌症例の多様なコホートにわたるTMBの分布と,100以上の腫瘍型における体細胞変化とTMBの間の関連を試験した。結果:包括的なゲノムプロファイリングからのTMBの測定は,全体のエクソーム配列決定と0.5Mb以下のモデルからの測定の強い反射性を示し,測定の分散は有意に増加した。患者のサブセットは,多くの稀な腫瘍型を含むほとんど全てのタイプの癌にわたり高いTMBを示し,高いTMBとマイクロサテライト不安定性状態の間の関係を特徴付けることを見出した。TMBは年齢と共に有意に増加し,年齢10~90歳の間で2.4倍の差を示した。最後に,TMBの分子基盤を調べ,TMBレベルに関連する遺伝子と変異を同定した。著者らは,皮膚癌の10%で発生する遺伝子PMS2のプロモーターにおける体細胞突然変異のクラスターを同定し,TMBの増加と高度に関連している。【結論】これらの結果は,コード化ゲノムの1.1mbを標的とするCGP分析が,全体のエキソソームの配列決定と比較してTMBを正確に評価できることを示している。この方法を用いて,多くの疾患型が免疫療法から利益を得る可能性のある高いTMBを有する患者の実質的な部分を有することを見出した。最終的に,著者らは,腫瘍形成に寄与する調節突然変異のもう一つの例である可能性がある,PMS2における新規で再発性のプロモーター突然変異を同定する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 部分集合 ,  *ゲノム ,  *ヒト ,  体細胞 ,  バイオマーカー ,  患者 ,  突然変異 ,  *変異 ,  *腫瘍 ,  プロモーター領域 ,  免疫組織化学 ,  ターゲティング ,  再発 ,  免疫療法
準シソーラス用語： エキソソーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 腫瘍変異負荷 ,  癌ゲノミクス ,  ミスマッチ修復 ,  PMS2

分類 (2件)： 腫ようの免疫療法  (GE03035B) ,  腫よう免疫  (ED03040A)

引用文献 (75件)：

• Nature.; Cancer immunotherapy comes of age; I Mellman, G Coukos, G Dranoff; 480; 2011; 480-9; 10.1038/nature10673; CR1;
• N Engl J Med.; Safety, activity, and immune correlates of anti-PD-1 antibody in cancer; SL Topalian, FS Hodi, JR Brahmer, SN Gettinger, DC Smith, DF McDermott; 366; 2012; 2443-54; 10.1056/NEJMoa1200690; CR2;
• Semin Oncol.; Immunologic checkpoints blockade in renal cell, prostate, and urothelial malignancies; S Bracarda, A Altavilla, A Hamzaj, M Sisani, F Marrocolo, S Buono; 42; 2015; 495-505; 10.1053/j.seminoncol.2015.02.004; CR3;
• N Engl J Med.; PD-1 Blockade in tumors with mismatch-repair deficiency; DT Le, JN Uram, H Wang, BR Bartlett, H Kemberling, AD Eyring; 372; 2015; 2509-20; 10.1056/NEJMoa1500596; CR4;
• N Engl J Med.; Nivolumab versus everolimus in advanced renal-cell carcinoma; RJ Motzer, B Escudier, DF McDermott, S George, HJ Hammers, S Srinivas; 373; 2015; 1803-13; 10.1056/NEJMoa1510665; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  癌ゲノム ,  分析 ,  腫瘍 ,  変異 ,  景観