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J-GLOBAL ID：201802279063591417   整理番号：18A0356227

和牛から検出されたロタウイルスBのVP3,NSP3,およびNSP4の多様性【Powered by NICT】

Diversity in VP3, NSP3, and NSP4 of rotavirus B detected from Japanese cattle

著者 (23件)： Hayashi-Miyamoto Michiko (Ishikawa Prefectural Livestock Research Center, Hodatsushimizu, Ishikawa 929-1325, Japan) ,  Murakami Toshiaki (Ishikawa Hokubu Livestock Hygiene Service Center, Nanao, Ishikawa 929-2126, Japan) ,  Minami-Fukuda Fujiko (Ishikawa Hokubu Livestock Hygiene Service Center, Nanao, Ishikawa 929-2126, Japan) ,  Tsuchiaka Shinobu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Kishimoto Mai (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Sano Kaori (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Naoi Yuki (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Asano Keigo (Department of Bioproduction Science, Ishikawa Prefectural University, Nonoichi, Ishikawa 921-8836, Japan) ,  Ichimaru Toru (Department of Health and Medical Sciences, Ishikawa Prefectural Nursing University, Kahoku, Ishikawa 929-1210, Japan) ,  Haga Kei (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Haga Kei (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Omatsu Tsutomu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Yukie (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oba Mami (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Aoki Hiroshi (Faculty of Veterinary Science, Nippon Veterinary and Life Science University, Musashino, Tokyo 180-8602, Japan) ,  Shirai Junsuke (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Shirai Junsuke (Department of Veterinary Medicine, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Ishida Motohiko (Department of Bioproduction Science, Ishikawa Prefectural University, Nonoichi, Ishikawa 921-8836, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Katayama Kazuhiko (Laboratory of Viral Infection I, Kitasato Institute for Life Sciences, Graduate School of Infection Control Sciences, Minato, Tokyo 108-8641, Japan) ,  Mizutani Tetsuya (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Nagai Makoto (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Nagai Makoto (Department of Bioproduction Science, Ishikawa Prefectural University, Nonoichi, Ishikawa 921-8836, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 49  ページ： 97-103  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ウシロタウイルスB(RVB)は,成牛の下痢の病原体である。現在,ウイルス蛋白質(VP)1 2 4 6,および7とウシRVBの非構造蛋白質(NSP)1 2,および5のいくつかの配列はDDBJ/EMBL/GenBankデータベースで利用可能な,VP3,NSP3,およびNSP4の報告されていないものはなかった。ウシRVB株の遺伝的特性化におけるこのギャップを埋めるために,メタゲノムの手法を用いて,VP3,NSP3,およびNSP4遺伝子の完全コード配列(CDS)だけでなく,和牛から検出されたRVBsの他の遺伝子の部分的または完全CDS配列を決定し,解析した。ウシRVBsのVP3,NSP3,およびNSP4はマウス,ヒト,及びブタRVBsのそれと低いヌクレオチド配列同一性(VP3,NSP3の65.9 68.2%,52.6 56.2%63.3 64.9%NSP4)を共有し,ウシRVBsは新しい遺伝子型に属することを示唆した。さらに,ウシRVBsと他の種のRVBs間のNSP4(36.1 39.3%)で観察された有意に低いアミノ酸配列同一性。とは対照的に,NSP4の疎水性プロット分析は,他の種のRVBsとロタウイルスA(RVA)株のそれらに類似したプロフィルを明らかにした。全遺伝子セグメントの系統発生分析は,ウシRVB株は他のRVBsから離れた枝分かれしたクラスタを形成することを明らかにした。これらの結果は,ウシRVBsは他のRVBsから他のロタウイルスと同様に独立して進化したことを示唆した。これらの知見は,RVB株の進化と多様性への洞察を提供した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： アミノ酸 ,  配列相同性 ,  ウイルスタンパク質 ,  病原体 ,  クラスタ ,  遺伝子 ,  データベース ,  *ロタウイルス ,  ヒト ,  遺伝子型 ,  系統解析 ,  メタゲノム ,  GenBank ,  ウシロタウイルス ,  *和牛 ,  *微生物

著者キーワード (5件)： ウシロタウイルスB ,  日本 ,  メタゲノミクスアプローチ ,  遺伝的特性化 ,  新しい遺伝子型

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  ウイルスの形態学,分類学  (EG04020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： 和牛 ,  ロタウイルス ,  多様性