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J-GLOBAL ID：201802279833146771   整理番号：18A1213352

安定同位体誘導NMRメタボロミクスにより追跡した細菌基質形質転換:天然水生微生物群集への応用【JST・京大機械翻訳】

Bacterial Substrate Transformation Tracked by Stable-Isotope-Guided NMR Metabolomics: Application in a Natural Aquatic Microbial Community

著者 (9件)： Uchimiya Mario (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Tsuboi Yuuri (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Ito Kengo (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Ito Kengo (Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Date Yasuhiro (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Date Yasuhiro (Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Kikuchi Jun (RIKEN Center for Sustainable Resource Science, 1-7-22 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Kikuchi Jun (Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, 1-7-29 Suehiro, Tsurumi, Yokohama, Kanagawa 230-0045, Japan) ,  Kikuchi Jun (Graduate School of Bioagricultural Sciences and School of Agricultural Sciences, Nagoya University, 1 Furo, Chikusa, Nagoya 464-8601, Japan)
資料名： Metabolites (Web)  (Metabolites (Web))
巻： 7  号： 4  ページ： 52  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7243A  ISSN： 2218-1989  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水生環境における従属栄養細菌による有機基質の変換は,世界的な物質循環における重要なプロセスの1つを構成する。水生細菌によって変換される広範囲の有機化合物を追跡することを可能にする手順の開発は,材料サイクルの理解を大いに改善するであろう。本研究では,天然水生細菌群集における代謝産物変換の研究に対する安定同位体標識と結合した核磁気共鳴分光法の適用性を調べた。沿岸海水試料へのモデル基質(13C6-グルコース)の添加とその後の培養は,13C6-グルコースから変換されると同定されたアミノ酸,ジペプチド,有機酸,ヌクレオシド,核酸塩基,及びアミノアルコールを含む種々の化学クラスからの>200のピークの検出と22の代謝産物の帰属をもたらした。追加実験により,代謝産物形質転換及び主要化合物の大きな変動性を明らかにし,培養期間にわたるグルタミン酸の細菌蓄積及び13C6-グルコース添加濃度の増加に伴う3-ヒドロキシブチラートの細菌蓄積を示した。これらの結果は,水生細菌群集における基質変換を追跡する著者らのアプローチの潜在的能力を示唆する。この手順のさらなる応用は,水生環境における代謝産物動力学への実質的洞察を提供する可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝産物 ,  有機化合物 ,  *基質 ,  *天然水 ,  アミノ酸 ,  *細菌 ,  *NMR【磁気共鳴】 ,  ジペプチド ,  *安定同位体 ,  アミノアルコール ,  有機酸 ,  ヌクレオシド
準シソーラス用語： 細菌群集 ,  水生細菌 ,  *メタボロミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 水環境 ,  従属栄養細菌 ,  細胞内代謝産物 ,  メタボロミクス ,  核磁気共鳴分光法 ,  安定同位体標識

分類 (1件)： 代謝と栄養  (EG03054K)

引用文献 (36件)：

• Madsen, E.L. Environmental Microbiology: From Genomes to Biogeochemistry; Blackwell Publishing: Oxford, UK, 2015; ISBN 978-1-4051-3647-1.
• Nicholson, J.K.; Lindon, J.C. Systems biology-Metabonomics. Nature 2008, 455, 1054-1056.
• Zhang, A.H.; Sun, H.; Wang, P.; Han, Y.; Wang, X.J. Modern analytical techniques in metabolomics analysis. Analyst 2012, 137, 293-300.
• Lindon, J.C.; Nicholson, J.K. Spectroscopic and statistical techniques for information recovery in metabonomics and metabolomics. Annu. Rev. Anal. Chem. 2008, 1, 45-69.
• Simpson, A.J.; Simpson, M.J.; Soong, R. Nuclear magnetic resonance spectroscopy and its key role in environmental research. Environ. Sci. Technol. 2012, 46, 11488-11496.

タイトルに関連する用語 (10件)： 安定同位体 ,  誘導 ,  NMR ,  メタボロミクス ,  追跡 ,  細菌 ,  基質 ,  形質転換 ,  微生物群集 ,  応用