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J-GLOBAL ID：201802285450437951   整理番号：18A0965406

ラット肝再生のプライミング期における包括的CircRNA発現プロファイルと鍵となるCircRNAの選択【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive CircRNA expression profile and selection of key CircRNAs during priming phase of rat liver regeneration

著者 (10件)： Li Lifei (College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Li Lifei (State Key Laboratory Cultivation Base for Cell Differentiation Regulation and Henan Engineering Laboratory for Bioengineering and Drug Development, Xinxiang, China) ,  Guo Jianlin (College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Guo Jianlin (State Key Laboratory Cultivation Base for Cell Differentiation Regulation and Henan Engineering Laboratory for Bioengineering and Drug Development, Xinxiang, China) ,  Chen Yanhui (College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Chen Yanhui (State Key Laboratory Cultivation Base for Cell Differentiation Regulation and Henan Engineering Laboratory for Bioengineering and Drug Development, Xinxiang, China) ,  Chang Cuifang (College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Chang Cuifang (State Key Laboratory Cultivation Base for Cell Differentiation Regulation and Henan Engineering Laboratory for Bioengineering and Drug Development, Xinxiang, China) ,  Xu Cunshuan (College of Life Science, Henan Normal University, Xinxiang, China) ,  Xu Cunshuan (State Key Laboratory Cultivation Base for Cell Differentiation Regulation and Henan Engineering Laboratory for Bioengineering and Drug Development, Xinxiang, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 80  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ラット肝再生(LR)は,多くの生理学的過程が重要な役割を果たす可能性がある肝臓組織の損失または損傷に応じて,高度に組織化されて秩序化された組織成長の過程に沿って進行する。ラットLR中の肝細胞増殖,エネルギー代謝および物質代謝の分子機構を解明した。さらに,増殖に伴う円形RNA(circRNA)豊度の相関が最近明らかにされている。しかしながら,ラットLRにおけるcircRNAの調節能は魅力的な話題のままである。【結果】ラットLRのプライミング相の間のcircRNAの制御機構を研究するために,高スループットRNA配列技術を,ラットLRのプライミング期の間のcircRNAの発現を明らかにするために実行した。遺伝子オントロジー(GO)とGenおよびゲノム(KEGG)の生物学的経路分析の京都エンシクロペジアを,差別的に発現されたcircRNAおよびそれらの宿主線状転写物の機能を予測するために実施した。circRNA-miRNAの共発現ネットワークを,差次的に発現したLR関連circRNAとそれらのmiRNA結合部位の条件の間の相関分析に基づいて構築した。ラットLRの初期相における鍵となるcircRNAを明らかにするために,circRNAと線状転写物の間の発現レベルの関係と,circRNA配列におけるmiRNA結合部位の分布を包括的に評価し,統合した。結論:本論文は,包括的なcircRNA発現プロファイルを用いて,ラットLRのプライミング期の間のcircRNA-miRNA相互作用を調査することである。2つの4012のcircRNAsが検出され,116の宿主線状転写物から誘導された159のcircRNAが異なって発現した(p<0.05)。ラットLRのプライミング期における6つの有意に変化したcircRNAを,キーサークル分子としてスクリーニングし,qRT-PCRにより検証した。本研究は,ラットLRの間のcircRNAの機能的役割を明らかにするための基礎を築き,残りの臨床的問題を解決するのを助ける。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  エネルギー代謝 ,  ネットワーク ,  相互作用 ,  *肝再生 ,  *RNA【核酸】 ,  結合部位 ,  相関分析 ,  共発現 ,  マイクロRNA ,  遺伝子オントロジー ,  環状RNA ,  分子機構 ,  *遺伝子発現プロファイリング
準シソーラス用語： ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： 高スループットRNAシークエンシング技術 ,  CircRNA ,  ラット肝再生 ,  miRNA ,  宿主線状転写物 ,  肝細胞増殖 ,  エネルギー代謝 ,  物質代謝

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (63件)：

• J Proteome Res; Lipid metabolism and peroxisome proliferator-activated receptor signaling pathways participate in late-phase liver regeneration; X Yuan, M Miao; 10; 3; 2011; 1179-90; 10.1021/pr100960h; CR1;
• Hepatol (Baltimore, Md); Heterogeneity and plasticity of hepatocyte lineage cells; 33; 3; 2001; 738-50; 10.1053/jhep.2001.21900; CR2;
• Faseb J; Liver regeneration. 2. Role of growth factors and cytokines in hepatic regeneration; N Fausto, AD Laird, EM Webber; 9; 15; 1995; 1527-36; CR3;
• Cell; Akt Phosphorylation of BAD Couples Survival Signals to the Cell-Intrinsic Death Machinery; SR Datta, H Dudek, X Tao, S Masters, H Fu, Y Gotoh, ME Greenberg; 91; 2; 1997; 231-41; 10.1016/S0092-8674(00)80405-5; CR4;
• Int J Mol Sci; Cell survival and apoptosis signaling as therapeutic target for cancer: marine bioactive compounds; S Kalimuthu, K Sekwon; 14; 2; 2013; 2334-54; 10.3390/ijms14022334; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： ラット ,  肝再生 ,  プライミング ,  circRNA ,  発現プロファイル ,  鍵