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J-GLOBAL ID：201802287622464595   整理番号：18A0491400

アクリルアミド系ヒト組織トランスグルタミナーゼ阻害剤のセットの反応プロファイリング【Powered by NICT】

Reaction profiling of a set of acrylamide-based human tissue transglutaminase inhibitors

著者 (2件)： Jasim Mahmood H. (School of Life and Health Sciences, Aston University, Birmingham B4 7ET, United Kingdom) ,  Rathbone Daniel L. (School of Life and Health Sciences, Aston University, Birmingham B4 7ET, United Kingdom)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 79  ページ： 157-165  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 酵素ヒト組織トランスグルタミナーゼ(T G2)の主要な機能は,グルタミンのγカルボキサミドとリジンのε-アミノ基の間のアミノ基転移を介して蛋白質の架橋である。T G2の過剰発現は,望ましくない結果をもたらすことができ,線維症,セリアック病と神経変性疾患のような条件に関連している。,T G2は魅力的な薬物標的である。今日までの最も効果的なT G2阻害剤は活性部位触媒システイン(CYS277)を不可逆的にことを小分子ペプチド模倣体を特徴とする求電子弾頭である。このようなT G2阻害剤の設計を容易にするために,六アクリルアミド系知られているT G2阻害剤とT G2CYS277セットの間のMichael反応の量子力学的反応プロファイリングを行った。阻害剤は活性部位にドッキングし,座標はCYS277チオラートの共有結合修飾をモデル化する前のMDシミュレーションにより精密化した。Michael反応を駆動する反応座標に適用したQM/MMMDアンブレラサンプリングの結果は,Michael反応の二つの近似を提示した:協奏反応(隣接HIS335からのアクリルアミド弾頭及び回内への同時チオラート攻撃)と2段階反応(連続チオラート攻撃とプロトン化)。Michael反応の2段階近似はin silicoアクリルアミド系ポテンシャルT G2阻害剤の評価のための良い結果を与えた。範囲0.0061 6μM(三桁の大きさ)にわたる実験T G2IC_50データと計算した活性化エネルギー間の良好な関係を観察した,この方法はアクリルアミド系ポテンシャルT G2阻害剤を評価するのに使用できることを提案した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 分子動力学 ,  酵素 ,  小分子 ,  タンパク質 ,  アミノ基 ,  Michael反応 ,  モデリング ,  活性化エネルギー ,  活性部位 ,  *ヒト ,  プロトン化 ,  カルボアミド ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ジカルボン酸 ,  第一アミン ,  ビニル化合物 ,  不飽和カルボン酸
準シソーラス用語： *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 組織トランスグルタミナーゼ ,  不可逆阻害剤 ,  分子ドッキング ,  分子動力学 ,  アンブレラサンプリング

分類 (2件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (2件)： グルタミン ,  アクリルアミド

タイトルに関連する用語 (5件)： アクリルアミド ,  ヒト ,  組織トランスグルタミナーゼ ,  阻害剤 ,  プロファイリング