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J-GLOBAL ID：201802288516487958   整理番号：18A1350431

ネパール,カトマンズ渓谷における宿主特異的Bacteroidales定量的PCRアッセイの検証と飲料水源の微生物源追跡への応用【JST・京大機械翻訳】

Validation of host-specific Bacteroidales quantitative PCR assays and their application to microbial source tracking of drinking water sources in the Kathmandu Valley, Nepal

著者 (9件)： Malla B. (Department of Natural, Biotic and Social Environment Engineering, University of Yamanashi, Kofu, Yamanashi, Japan) ,  Ghaju Shrestha R. (Department of Natural, Biotic and Social Environment Engineering, University of Yamanashi, Kofu, Yamanashi, Japan) ,  Tandukar S. (Department of Natural, Biotic and Social Environment Engineering, University of Yamanashi, Kofu, Yamanashi, Japan) ,  Bhandari D. (Institute of Medicine, Tribhuvan University, Maharajgunj, Kathmandu, Nepal) ,  Inoue D. (Division of Sustainable Energy and Environmental Engineering, Osaka University, Suita, Osaka, Japan) ,  Sei K. (Department of Health Science, Kitasato University, Sagamihara, Kanagawa, Japan) ,  Tanaka Y. (Department of Environmental Sciences, University of Yamanashi, Kofu, Yamanashi, Japan) ,  Sherchand J.B. (Institute of Medicine, Tribhuvan University, Maharajgunj, Kathmandu, Nepal) ,  Haramoto E. (Interdisciplinary Center for River Basin Environment, University of Yamanashi, Kofu, Yamanashi, Japan)
資料名： Journal of Applied Microbiology  (Journal of Applied Microbiology)
巻： 125  号： 2  ページ： 609-619  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0635A  ISSN： 1364-5072  CODEN： JAMIFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:Nepal,Kathmandu Valleyにおける飲料水源の糞便汚染源汚染を同定するための宿主特異的Bacteroidalesアッセイを検証すること。方法と結果:ヒトの下水,反芻動物,ブタ,イヌ,ニワトリおよびアヒルから合計54の複合糞便汚染源サンプルを収集し,ヒト特異的(BacHum,HF183SYBR,gyrBおよびHF183TaqMan),ブタ特異的(Pig2BacおよびPF163)およびドッグ特異的アッセイ(BacCan SYBR)を用いた定量的ポリメラーゼ連鎖反応により分析した。BacHum,BacR及びPig2Bacアッセイは,それぞれ,ヒト特異的,反芻動物特異的及びブタ特異的アッセイを最良に実施すると判断した。BacCan SYBRアッセイは他の種と高度に交差反応し,結果として劣った性能をもたらした。さらに,これらの検証された分析を,74の飲料水試料の微生物源追跡(MST)に適用した。これらのうち,20,12および4%の試料は,それぞれヒト,反芻動物およびブタ糞便によって汚染されていると判断された。ヒトと反芻動物の糞便マーカーの検出率は,それぞれ,構成された地域と農業地域において比較的高かった。結論:BacHum,BacRおよびPig2Bac分析はMSTに適しており,飲料水源のヒトおよび動物糞便汚染の両方が谷において一般的であることが分かった。有意性とIMPACT OHE STUDY:MSTは,これらが部位特異的であるので,糞便汚染戦略を調製するための効果的なツールとなり得る。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *飲料 ,  下水 ,  動物 ,  反芻動物 ,  微生物汚染 ,  ヒト ,  *ネパール連邦民主共和国 ,  アヒル ,  *飲用水 ,  農業地区 ,  水試料 ,  *定量的PCR法
準シソーラス用語： *カトマンズ ,  *Bacteroidales目 ,  糞便汚染 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 飲料水 ,  同定 ,  微生物汚染 ,  ポリメラーゼ連鎖反応 ,  水

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (11件)： ネパール ,  カトマンズ ,  渓谷 ,  宿主 ,  Bacteroidales ,  定量的PCR ,  アッセイ ,  検証 ,  飲料水 ,  微生物源追跡 ,  応用