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J-GLOBAL ID：201802288599243583   整理番号：18A1247541

結核に対する強力な阻害剤の探索における分子動力学シミュレーション,受容体結合研究および薬理作用団マッピング分析の統合計算アプローチ【JST・京大機械翻訳】

An integrated computational approach of molecular dynamics simulations, receptor binding studies and pharmacophore mapping analysis in search of potent inhibitors against tuberculosis

著者 (8件)： Agarwal Shivangi (Department of Pharmaceutical Sciences, Dr. Harisingh Gour University (A Central University), Sagar, MP, India) ,  Verma Ekta (Department of Pharmaceutical Sciences, Dr. Harisingh Gour University (A Central University), Sagar, MP, India) ,  Kumar Vivek (Department of Plant and Soil Sciences, University of Pretoria, South Africa) ,  Lall Namrita (Department of Plant and Soil Sciences, University of Pretoria, South Africa) ,  Sau Samaresh (Use-inspired Biomaterials & integrated Nano Delivery (U-BiND) Systems Laboratory, Department of Pharmaceutical Sciences, Wayne State University, Detroit, MI, USA) ,  Iyer Arun K. (Use-inspired Biomaterials & integrated Nano Delivery (U-BiND) Systems Laboratory, Department of Pharmaceutical Sciences, Wayne State University, Detroit, MI, USA) ,  Iyer Arun K. (Molecular Imaging Program, Karmanos Cancer Institute, Detroit, MI, USA) ,  Kashaw Sushil K. (Department of Pharmaceutical Sciences, Dr. Harisingh Gour University (A Central University), Sagar, MP, India)
資料名： Journal of Molecular Graphics & Modelling  (Journal of Molecular Graphics & Modelling)
巻： 83  ページ： 17-32  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0044D  ISSN： 1093-3263  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 結核は世界中で数百万人の人々に影響を及ぼす病原体Mycobacterium tuberculosisにより引き起こされる感染性慢性疾患である。多くの第一および第二の薬剤はその治療に利用可能であるが,それらの不合理な使用は,複数の薬剤耐性および広範囲の薬物耐性結核の新たな症例に有害になっている。したがって,その治療のための新しい強力な類似体を開発することが強い必要がある。これはTBに対する強力な類似体の開発を促した。結核菌ゲノムはTBに対抗するために検証された標的の数を提供する。Mtbゲノムの研究により,有害なエポキシドをジオールに変換し,合理的な薬物設計のための潜在的薬物標的として作用する6つのエポキシドヒドロラーゼ(AからF)を明らかにした。著者らの現在の戦略は,Mtbゲノムに存在するエポキシドヒドロラーゼ酵素を阻害するそのような類似体を開発することである。これを達成するために,QSAR,薬理作用団マッピング,分子ドッキングおよび分子動力学シミュレーション研究を含む統合計算アプローチを採用した。このアプローチは,エポキシドヒドロラーゼの活性部位に結合する化合物に対する分子記述子,必須の薬理学的特徴及び結合エネルギーの役割に関する重要な情報を予想した。分子ドッキング分析は,類似体がMtbエポキシドヒドロラーゼに有意な結合を示すことを明らかにした。さらに,分子動力学シミュレーション研究のために,それぞれ,高,中程度および低いドッキングスコアを有する3つのドッキング錯体2s,37sおよび15sを選択した。RMSD分析は,すべての錯体が10nsシミュレーションを通して2Å以下の平均RMSDで安定であることを明らかにした。B因子分析は,エポキシドヒドロラーゼの活性部位残基が阻害剤と相互作用するのに十分柔軟であることを示した。さらに,これらの尿素誘導体の結合を確認するために,MM-GBSA結合エネルギー分析を行った。計算は,37sが2s(ΔGtotal=-51.70kcal/mol)および15s(ΔGtotal=-49.97kcal/mol)と比較して,エポキシドヒドロラーゼに対してより多くの結合親和性(ΔGtotal=-52.24kcal/mol)を有することを示した。著者らの研究で推論された構造的特徴は,抗TB特性を示す新しい化学実体の発見に向けて科学者に将来の方向を提供する可能性がある。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エポキシドヒドラターゼ ,  活性部位 ,  定量的構造活性相関 ,  相互作用 ,  *計算機シミュレーション ,  薬物耐性 ,  結核菌 ,  ジオール ,  *結核 ,  ドラッグデザイン ,  ゲノム ,  ドッキング
準シソーラス用語： 分子ドッキング ,  エポキシ化合物 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *阻害剤 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 分子動力学シミュレーション ,  薬理作用団マッピング ,  分子ドッキング ,  エポキシドヒドロラーゼ ,  結核

分類 (3件)： 分子化合物  (CE02000C) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (10件)： 結核 ,  阻害剤 ,  探索 ,  分子動力学シミュレーション ,  受容体結合 ,  研究 ,  薬理作用団マッピング ,  分析 ,  統合 ,  計算