文献

J-GLOBAL ID：201802288689340824   整理番号：18A1154586

根圏細菌群集の日周サイクルは炭素代謝におけるシフトと関連する【JST・京大機械翻訳】

Diurnal cycling of rhizosphere bacterial communities is associated with shifts in carbon metabolism

著者 (20件)： Staley Christopher (BioTechnology Institute, University of Minnesota, Saint Paul, USA) ,  Ferrieri Abigail P. (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Tfaily Malak M. (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Cui Yaya (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Chu Rosalie K. (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Wang Ping (BioTechnology Institute, University of Minnesota, Saint Paul, USA) ,  Shaw Jared B. (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Ansong Charles K. (Biological Sciences Division, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Brewer Heather (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Norbeck Angela D. (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Markillie Meng (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Amaral Fernanda do (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Tuleski Thalita (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Pellizzaro Tomas (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Agtuca Beverly (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Ferrieri Richard (Department of Chemistry, University of Missouri Research Reactor, Columbia, USA) ,  Tringe Susannah G. (Microbial Systems Group, Metagenome Program, DOE Joint Genome Institute, Walnut Creek, USA) ,  Pasa-Tolic Ljiljana (Environmental Molecular Sciences Laboratory, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Stacey Gary (Division of Plant Science and Biochemistry, C.S. Bond Life Science Center, University of Missouri, Columbia, USA) ,  Sadowsky Michael J. (BioTechnology Institute, University of Minnesota, Saint Paul, USA)
資料名： Microbiome (Web)  (Microbiome (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 65  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7333A  ISSN： 2049-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:概日時計は植物代謝機能を調節し,植物の健康と生産性における重要な要素である。根圏細菌は,植物成長,健康,および発達において重要な役割を果たし,主に土壌コミュニティによって形成される。Illumina次世代配列決定と高分解能質量分析を用いて,野生型(Col-0)Arabidopsis thalianaの細菌群集と概日時計関連cca1転写因子を発現する非環状系統(OX34)を土壌対照と比較して特性化し,循環動態が微生物群集にどのように影響するかを決定した。Bradidium distachyon(Bd21)に関連する微生物群集も評価した。【結果】有意に異なる細菌群集構造(P=0.031)が,光と暗周期サンプルの間の野生型植物の根圏で観察された。さらに,群落の13%は,光周期に対する豊度の変動を示す,Burkholderia科,Rhodospiraceae,Plancomycetaceae,およびGaiellaceaeを含むいくつかの科の豊度を有する循環を示した。しかし,非環状CCAox34系統または土壌対照においては,制限されない循環が観察された。また,有意な循環が観察された。機能的遺伝子の推論により,炭水化物代謝に関与する遺伝子は,暗い試料においてより豊富に存在することが明らかになった。さらに,根圏における有機物の組成は暗と光サイクルの間で有意な変化を示した。結論:本研究の結果は,根圏細菌群集が概日時計によりある程度調節され,植物代謝と生産性に影響を及ぼす可能性があることを示唆する。Arabidopsisとの関連における細菌循環のタイミングは,日内動態が植物-微生物炭素代謝と交換に影響することを示唆する。同様に重要なことに,著者らの結果は,日の時間との関連なしで行われた以前の研究が,根圏微生物群集に及ぼす日周期の影響に関して再評価される必要があることを示唆する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Burkholderia ,  植物成長 ,  *根圏 ,  *代謝 ,  有機物 ,  微生物 ,  Arabidopsis ,  *細菌 ,  キャラクタリゼーション ,  日周期 ,  遺伝子 ,  野生型
準シソーラス用語： *根圏細菌 ,  概日時計 ,  *細菌群集 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 細菌群集構造 ,  日周リズム ,  根圏 ,  シロイヌナズナ

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

引用文献 (72件)：

• Trends Microbiol; Properties of bacterial endophytes and their proposed role in plant growth; PR Hardoim, LS Overbeek, JD Elsas; 16; 2008; 463-71; 10.1016/j.tim.2008.07.008; CR1;
• Bulgarelli D, Rott M, Schlaeppi K, Van Themaat EV, Ahmadinejad N, Assenza F, et al. Revealing structure and assembly cues for Arabidopsis root-inhabiting bacterial microbiota. Nature. 2012;488:91-5.
• Lundberg DS, Lebeis SL, Paredes SH, Yourstone S, Gehring J, Malfatti S, et al. Defining the core Arabidopsis thaliana root microbiome. Nat. 2012;488:86-90.
• FEMS Microbiol Ecol.; Plant species and soil type cooperatively shape the structure and function of microbial communities in the rhizosphere; G Berg, K Smalla, I Ahrenholtz, K Harms, VJ De, W Wackernagel; 68; 2009; 1-13; 10.1111/j.1574-6941.2009.00654.x; CR4;
• Nat Plants; Associations with rhizosphere bacteria can confer an adaptive advantage to plants; CH Haney, BS Samuel, J Bush, FM Ausubel, MG Hospital; 1; 2015; 1-22; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： 根圏細菌 ,  群集 ,  サイクル ,  炭素代謝 ,  シフト