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J-GLOBAL ID：201802288709965781   整理番号：18A1031111

土壌と葉圏酵母の競合アッセイと生理学的実験は糸状菌の新規アンタゴニストとしてCandida subhashiiを同定する【JST・京大機械翻訳】

Competition assays and physiological experiments of soil and phyllosphere yeasts identify Candida subhashii as a novel antagonist of filamentous fungi

著者 (6件)： Hilber-Bodmer Maja (Agroscope, Institute for Plant Production Sciences IPS, Waedenswil, Switzerland) ,  Schmid Michael (Agroscope, Institute for Plant Production Sciences IPS, Waedenswil, Switzerland) ,  Schmid Michael (SIB, Swiss Institute of Bioinformatics, Waedenswil, Switzerland) ,  Ahrens Christian H. (Agroscope, Institute for Plant Production Sciences IPS, Waedenswil, Switzerland) ,  Ahrens Christian H. (SIB, Swiss Institute of Bioinformatics, Waedenswil, Switzerland) ,  Freimoser Florian M. (Agroscope, Institute for Plant Production Sciences IPS, Waedenswil, Switzerland)
資料名： BMC Microbiology (Web)  (BMC Microbiology (Web))
巻： 17  号： 1  ページ： 4  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7367A  ISSN： 1471-2180  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】次世代シークエンシング技術における最近の進歩は,研究者が土壌,根圏,および葉圏微生物における無数の微生物種を容易に同定することを可能にした。これらの種の大部分の生物学的機能は未知である。したがって,機能的研究は,同定され,バイオテクノロジーまたは植物保護に使用される可能性のある種を指摘するために,多くの微生物を特性化するために緊急に必要である。ここでは,酵母(40の異なる分離株)を特性化するための二重培養アッセイと増殖分析,および16の糸状菌に対するそれらの拮抗効果を用いた。植物病原体,拮抗剤,および腐生植物から成る。結果:全体として,640対の組合せのこの競合スクリーニングは,個々の種による80%以上の成長阻害までのいくつかの酵母の小刺激効果から広範囲の結果を明らかにした。平均して,土壌から分離された酵母は葉圏酵母よりも強く糸状菌を抑制し,拮抗活性は特異的/分離特異的性質であり,糸状菌に依存しなかった。酵母は相互作用していた。最も強い拮抗活性を持つ分離株は,Metschnikowia pulcherrima,Hanseniaspora sp.,Cyberlindnera sargentensis,Aureobasidium pullulans,Candida subhashii,およびPichia kluyveriであった。これらの中で,土壌酵母(C.sargentensis,A.pullulans,C.subhashii)は,葉圏からの酵母よりも,より多くの二,三および四糖類および有機酸を同化し,酸化した。炭素源としてN-アセチル-グルコサミンを用いると,2つの酵母C.subhashiiとM.pulcherrimaのみが成長した。結論:ここで述べた競合アッセイと生理学的実験は,過去の植物病原性真菌の生物学的制御に関わる既知の拮抗剤を同定したが,C.subhashiiのようなほとんど特性化されていない種も同定した。全体として,土壌酵母は,葉圏からの酵母よりも拮抗的で代謝的に多様であった。注目すべきことは,土壌酵母C.subhashiiの強い拮抗活性であり,これはこれまで臨床試料からしか報告されておらず,生物学的防除に関しては研究されていない。二成分競合アッセイと成長分析(例えば,異なる炭素源,根浸出液中の成長)に基づいて,C.subhashiiは植物病原性菌類に対する新規生物防除剤としての可能性を持つ競争的で拮抗的な土壌酵母として同定された。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 根圏 ,  生物的防除 ,  植物病原菌 ,  有機酸 ,  培養 ,  キャラクタリゼーション ,  病原体 ,  *酵母 ,  スクリーニング ,  生物農薬 ,  *糸状菌類 ,  バイオテクノロジー ,  *Candida ,  拮抗作用
準シソーラス用語： 炭素源 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 拮抗作用 ,  生物防除 ,  Candida ,  真菌植物病原菌 ,  ミトコンドリアゲノム ,  植物保護 ,  酵母

分類 (3件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  生物的防除  (FC05030B) ,  菌類による植物病害  (FC04052Y)

引用文献 (107件)：

• Koike ST, Subbarao KV, Davis RM, Turini TA. Vegetable diseases caused by soilborne pathogens. University of California ANR Publications; 2003. 8099
• Mol Plant Pathol; Secrets of the subterranean pathosystem of Armillaria; K Baumgartner, MP Coetzee, D Hoffmeister; 12; 6; 2011; 515-534; 10.1111/j.1364-3703.2010.00693.x; CR2;
• Crop Sci; Constraints on Asparagus production: the association of Ophiomyia simplex (Diptera: Agromyzidae) and Fusarium spp; WR Morrison, JK Tuell, MK Hausbeck, Z Szendrei; 51; 2011; 1414-1423; 10.2135/cropsci2011.01.0032; CR3;
• Soil Use Manag; Microbial dynamics and natural remediation patterns of Fusarium-infested watermelon soil under 3-yr of continuous fallow condition; H-S Wu, Z-G Gao, X-D Zhou, XB Shi, M-Y Wang, X-X Shang, Y-D Liu, D-L Gu, W-Z Wang; 29; 2; 2013; 220-229; 10.1111/sum.12029; CR4;
• Biol Fert Soils; Manipulating the soil microbiome to increase soil health and plant fertility; JM Chaparro, AM Sheflin, DK Manter, JM Vivanco; 48; 5; 2012; 489-499; 10.1007/s00374-012-0691-4; CR5;

タイトルに関連する用語 (10件)： 土壌 ,  葉圏 ,  酵母 ,  競合アッセイ ,  生理学 ,  実験 ,  糸状菌 ,  アンタゴニスト ,  Candida ,  同定