文献

J-GLOBAL ID：201802289396349772   整理番号：18A1004974

単一細胞集団をモデル化するための階層的データ駆動アプローチは細胞間変動の潜在的原因を予測する【JST・京大機械翻訳】

A Hierarchical, Data-Driven Approach to Modeling Single-Cell Populations Predicts Latent Causes of Cell-To-Cell Variability

著者 (8件)： Loos Carolin (Helmholtz Zentrum Muenchen-German Research Center for Environmental Health, Institute of Computational Biology, 85764 Neuherberg, Germany) ,  Loos Carolin (Technische Universitaet Muenchen, Center for Mathematics, Chair of Mathematical Modeling of Biological Systems, 85748 Garching, Germany) ,  Moeller Katharina (Division of Experimental Anesthesiology and Pain Research, Department of Anesthesiology and Intensive Care Medicine, University Hospital Cologne, 50937 Cologne, Germany) ,  Frohlich Fabian (Helmholtz Zentrum Muenchen-German Research Center for Environmental Health, Institute of Computational Biology, 85764 Neuherberg, Germany) ,  Frohlich Fabian (Technische Universitaet Muenchen, Center for Mathematics, Chair of Mathematical Modeling of Biological Systems, 85748 Garching, Germany) ,  Hucho Tim (Division of Experimental Anesthesiology and Pain Research, Department of Anesthesiology and Intensive Care Medicine, University Hospital Cologne, 50937 Cologne, Germany) ,  Hasenauer Jan (Helmholtz Zentrum Muenchen-German Research Center for Environmental Health, Institute of Computational Biology, 85764 Neuherberg, Germany) ,  Hasenauer Jan (Technische Universitaet Muenchen, Center for Mathematics, Chair of Mathematical Modeling of Biological Systems, 85748 Garching, Germany)
資料名： Cell Systems  (Cell Systems)
巻： 6  号： 5  ページ： 593-603.e13  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3087A  ISSN： 2405-4712  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 全ての生物学的システムは細胞から細胞への可変性を示す。細胞状態における確率的変動と過渡的差異が細胞応答における実験的に観察可能な変化にどのように寄与するかを理解するための枠組みが存在する。しかしながら,現在の方法は,細胞の安定した亜母集団の間の変動性の源の同定を可能にしない。不均一サブ集団から成る集団の解析のためのデータ駆動モデリングフレームワークを示した。著者らのアプローチは,分布近似のためのフレームワークと混合モデリングを結合し,複数の単一細胞データセットの統合とサブポピュレーション間の因果的差異の検出を容易にする。著者らのフレームワークの計算効率は,数百の競合する仮説を比較することを可能にした。最初に,理解されたグランドトルースを用いてシミュレーションデータを用いてこの方法を検証し,次に,疼痛開始に関与する培養感覚ニューロンの定量的単細胞顕微鏡を用いて収集したデータを解析した。このアプローチにより,NGF/TrkA開始Erk1/2シグナル伝達における観察された細胞から細胞への可変性に対するニューロンサブ集団,培養条件,およびシグナル伝達蛋白質の発現レベルの相対的寄与を定量化することができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 知覚神経 ,  母集団 ,  疼痛 ,  近似法 ,  タンパク質 ,  不均一性 ,  顕微鏡 ,  *モデリング ,  培養条件 ,  培養
準シソーラス用語： trkA受容体 ,  Erk1/2 ,  グランドトゥルース ,  細胞応答 ,  *単一細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 異質性 ,  システム生物学 ,  単一細胞データ ,  混合物モデリング ,  統計的推論 ,  疼痛感作

分類 (3件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  細胞・組織培養法  (EA03040R) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 細胞集団 ,  モデル化 ,  データ駆動 ,  原因 ,  予測