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J-GLOBAL ID：201802297734846950   整理番号：18A0965601

ポプラ茎トランスクリプトームは単一または反復機械刺激に応答して大規模に再モデル化される【JST・京大機械翻訳】

Poplar stem transcriptome is massively remodelled in response to single or repeated mechanical stimuli

著者 (5件)： Pomies Lise (Universite Clermont Auvergne, INRA, PIAF, Clermont-Ferrand, France) ,  Decourteix Melanie (Universite Clermont Auvergne, INRA, PIAF, Clermont-Ferrand, France) ,  Franchel Jerome (Universite Clermont Auvergne, INRA, PIAF, Clermont-Ferrand, France) ,  Moulia Bruno (Universite Clermont Auvergne, INRA, PIAF, Clermont-Ferrand, France) ,  Leblanc-Fournier Nathalie (Universite Clermont Auvergne, INRA, PIAF, Clermont-Ferrand, France)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 300  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Treesは,機械的刺激のような風を経験し,それにより,植物成長および木材品質の改変をもたらす。この症候群は樹木生産性に影響するが,慢性風への樹木順応を改善すると信じられている。風は,それらの身長と多年性のため,樹木にとって特に挑戦的である。気候変動予測は,高い風の発生が悪化することを予測し,特に多年生植物において,チモーモフォロジーを制御する機構を理解することがますます重要になっている。拡張により,これは風エピソードの再帰性における因子を意味する。しかし,機械的シグナル伝達と機械的シグナル伝達を支える分子過程に関するデータ,およびそれらの動力学は樹木において依然として劇的に欠けている。【結果】著者らは,一時的および再帰制御された茎屈曲に対するポプラ転写反応性の全ゲノムおよび時系列分析を行い,風を模倣した。本研究は,ポプラゲノムの6%が単一の一時的な曲げの後に差別的に発現することを明らかにした。クラスタ化,遺伝子オントロジー分類および時系列発現アプローチの組合せは,遺伝子発現パターンの多様性および茎曲げにより影響される生物学的プロセスを明らかにした。短期トランスクリプトーム応答は,エチレン及びジャスモン酸シグナル伝達を含む植物防御及び非生物的ストレスシグナル伝達経路の急速な刺激をもたらした。後期トランスクリプトーム応答は細胞壁組織及び/又は木材発生に関与する遺伝子に影響した。再帰曲げの分子衝撃の解析により,最初の曲げ後に特異的に発現した遺伝子の大部分(96%)は,曲げへの第2の曝露後に,減少したか,または,正味ゼロ振幅調節を示すことが分かった。【結論】本研究は,ポプラにおける単一または反復茎曲げによって影響を受ける分子過程の最初の動的特性化を構成する。さらに,2番目の曲げ後に観察された転写応答の全体的減衰は,植物の応答性の微調整を支配する機構の存在を示している。この点は,現在,風順応の複雑な動力学を解明するために目標とすることができるいくつかの機構的経路に向かっている。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 風 ,  植物成長 ,  気候変動 ,  細胞壁 ,  木材 ,  時系列分析 ,  *トランスクリプトーム ,  *ハコヤナギ属 ,  形態形成 ,  順応 ,  ゲノム ,  クラスタ化 ,  *機械刺激 ,  予測 ,  アルケン

著者キーワード (8件)： メカノトランスダクション ,  時系列 ,  順応 ,  順応 ,  マイクロアレイ ,  胸腺形態形成 ,  非生物的ストレス ,  機械的刺激

分類 (2件)： 森林植物学  (FF02020E) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： エチレン

引用文献 (58件)：

• Tree Physiol; Thigmomorphogenesis: a dose response to flexing in Ulmus americana seedlings; FW Telewski, ML Pruyn; 18; 1998; 65-8; 10.1093/treephys/18.1.65; CR1;
• Ann Bot; Mechanical stimuli regulate the allocation of biomass in trees: demonstration with young Prunus avium trees; C Coutand, C Dupraz, G Jaouen, S Ploquin, B Adam; 101; 2008; 1421-32; 10.1093/aob/mcn054; CR2;
• Tree Physiol; Thigmomorphogenesis: changes in the morphology and mechanical properties of two Populus hybrids in response to mechanical perturbation; ML Pruyn, BJ Ewers, FW Telewski; 20; 2000; 535-40; 10.1093/treephys/20.8.535; CR3;
• Plant Physiol; Strain mechanosensing quantitatively controls diameter growth and PtaZFP2 gene expression in poplar; C Coutand, L Martin, N Leblanc-Fournier, M Decourteix, J-L Julien, B Moulia; 151; 2009; 223-32; 10.1104/pp.109.138164; CR4;
• Tree Physiol; Mechanical perturbation affects conductivity, mechanical properties and aboveground biomass of hybrid poplars; KA Kern, FW Ewers, FW Telewski, L Koehler; 25; 2005; 1243-51; 10.1093/treephys/25.10.1243; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： ポプラ ,  茎 ,  トランスクリプトーム ,  反復 ,  機械刺激 ,  応答 ,  大規模 ,  再モデル化