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J-GLOBAL ID：201802299115490469   整理番号：18A1154559

Proteobacteriaはヒト腸ミクロビオームにおける有意な機能的可変性を説明する【JST・京大機械翻訳】

Proteobacteria explain significant functional variability in the human gut microbiome

著者 (3件)： Bradley Patrick H. (Gladstone Institutes, San Francisco, USA) ,  Pollard Katherine S. (Gladstone Institutes, San Francisco, USA) ,  Pollard Katherine S. (Division of Biostatistics, Institute for Human Genetics, and Institute for Computational Health Sciences, University of California, San Francisco, USA)
資料名： Microbiome (Web)  (Microbiome (Web))
巻： 5  号： 1  ページ： 36  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7333A  ISSN： 2049-2618  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ヒト腸ミクロビオームは分類学的組成において有意に変化するが,生物学的経路豊度は宿主を通して驚くほど不変である。健康な微生物は,個体間の遺伝子豊度の違いを不明瞭にする因子により機能的に冗長に見えると仮定した。【結果】これらのバイアスを説明するために,著者らはCCoDAと呼ばれる遺伝子可変性の強力な試験を開発した。それはあらゆる環境からショットガンメタゲノムに適用可能であり,複数の研究からデータを統合することができる。3つの別々のコホートからの健康なヒト糞便メタゲノムの分析により,解糖酵素,リポ多糖類生合成遺伝子,および分泌系を含む人々の間に存在量が有意に異なる数千の遺伝子が明らかになった。ハウスキーピング経路は,ほとんどの高度に保存された遺伝子が有意に不変であるにもかかわらず,可変的で不変な遺伝子の混合を含んでいる。可変遺伝子は,腸型または優勢な門BacteroidetesとFirmicutesを定義するために用いられる分類群とは対照的に,Proteobacteriaと関連する傾向がある。【結論】これらの結果は,機能的冗長性に関する限界を確立し,腸の微生物の間の生理学的差異を説明する可能性がある特異的遺伝子と分類群を予測する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  微生物 ,  不変性 ,  *ヒト ,  バイアス ,  母集団 ,  酵素 ,  冗長性 ,  生理学
準シソーラス用語： Firmicutes ,  バクテロイデス門 ,  メタゲノム ,  健康 ,  *常在菌叢ゲノム ,  *プロテオバクテリア , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： ヒト腸ミクロビオーム ,  Proteobacteria ,  Bacteroidetes ,  Firmicutes ,  分散 ,  ショットガンメタゲノミクス ,  統計的方法 ,  機能的冗長性 ,  腸型 ,  ヒト腸ミクロビオーム

分類 (3件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  腸  (EJ06040N)

引用文献 (91件)：

• Science; Innate and adaptive immunity cooperate flexibly to maintain host-microbiota mutualism; E Slack, S Hapfelmeier, B Stecher, Y Velykoredko, M Stoel, MAE Lawson; 325; 5940; 2009; 617-20; 10.1126/science.1172747; CR1;
• Science; Induction of colonic regulatory T cells by indigenous Clostridium species; K Atarashi, T Tanoue, T Shima, A Imaoka, T Kuwahara, Y Momose; 331; 6015; 2011; 337-41; 10.1126/science.1198469; CR2;
• Science; Reversible microbial colonization of germ-free mice reveals the dynamics of IgA immune responses; S Hapfelmeier, MAE Lawson, E Slack, JK Kirundi, M Stoel, M Heikenwalder; 328; 5986; 2010; 1705-9; 10.1126/science.1188454; CR3;
• Science; Glycan foraging in vivo by an intestine-adapted bacterial symbiont; JL Sonnenburg, J Xu, DD Leip, CH Chen, BP Westover, J Weatherford; 307; 5717; 2005; 1955-9; 10.1126/science.1109051; CR4;
• Proc Natl Acad Sci U S A; Metabolomics analysis reveals large effects of gut microflora on mammalian blood metabolites; WR Wikoff, AT Anfora, J Liu, PG Schultz, SA Lesley, EC Peters; 106; 10; 2009; 3698-703; 10.1073/pnas.0812874106; CR5;

タイトルに関連する用語 (6件)： Proteobacteria ,  ヒト ,  腸 ,  ミクロビオーム ,  可変性 ,  説明