文献

J-GLOBAL ID：201902215564740874   整理番号：19A1273518

細胞応答の不均一性を制御するためのBooleネットワークの大域的安定化【JST・京大機械翻訳】

Global Stabilization of Boolean Networks to Control the Heterogeneity of Cellular Responses

著者 (3件)： Yang Jung-Min (School of Electronics Engineering, Kyungpook National University, Daegu, South Korea) ,  Lee Chun-Kyung (School of Electronics Engineering, Kyungpook National University, Daegu, South Korea) ,  Cho Kwang-Hyun (Laboratory for Systems Biology and Bio-inspired Engineering, Department of Bio and Brain Engineering, Korea Advanced Institute of Science and Technology, Daejeon, South Korea)
資料名： Frontiers in Physiology (Web)  (Frontiers in Physiology (Web))
巻： 9  ページ： 774  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7093A  ISSN： 1664-042X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Booleネットワーク(BN)は,システム生物学における分子調節ネットワークのための有用なモデルとして広く使われてきた。BNsの状態空間において,アトラクタは特定の細胞表現型を表す。癌の標的治療のために,癌細胞の悪い表現型に関連するアトラクタの数を減少させることにより,標的化薬物に対する細胞応答の不均一性を制御する必要がある。ここでは,ユニークな固定点へのBNの大域安定化のための新しい制御方式を提案した。隣接行列に関する大域的安定化の十分条件を用いて,制御BNを非指定不動点に向けて操縦し,その後の制御により望ましいアトラクタに変換できるように,一定の制御の集合を決定することができる。著者らの方法は,状態変数の数に関して多項式複雑性を有するが,BNsの程度に関して指数的複雑性を有することにおいて,この方法は効率的であった。提案した制御スキームの適用性を示すために,細胞の転移過程を記述する調節影響ネットワークと癌細胞運命決定において重要なマイトジェン活性化蛋白質キナーゼ(MAPK)シグナル伝達ネットワークを用いたシミュレーション研究を行った。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  不動点 ,  十分条件 ,  腫瘍細胞 ,  *不均一性 ,  アトラクタ ,  表現型 ,  シミュレーション ,  ターゲティング ,  適応性 ,  多項式
準シソーラス用語： 複雑性 ,  隣接行列 ,  遺伝子調節ネットワーク ,  *細胞応答 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Booleネットワーク(BNS) ,  グローバル安定化 ,  逐次制御 ,  異質性 ,  システム生物学

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (40件)：

• Akutsu T., Kuhara S., Maruyama O., Miyano S. (1998). A system for identifying genetic networks from gene expression patterns produced by gene disruptions and overexpressions. Genome Informatics 9, 151-160.
• Albert I., Thakar J., Li S., Zhang R., Albert R. (2008). Boolean network simulations for life scientists. Source Code Biol. Med. 3:16. doi: 10.1186/1751-0473-3-16
• Biane C., Delaplace F. (2017). "Abduction based drug target discovery using Boolean control network," in Computational Methods in Systems Biology (CMSB 2017). Lecture Notes in Computer Science, 10545, eds Feret J., Koeppl H. (Cham: Springer), 57-73. doi: 10.1186/1751-0473-3-16
• Bissell M. J., Hines W. C. (2011). Why don't we get more cancer? A proposed role of the microenvironment in restraining cancer progression. Nat. Med. 17, 320-329. doi: 10.1038/nm.2328
• BooleanNet. (2018). Available online at: https://github.com/ialbert/booleannet doi: 10.1038/nm.2328

タイトルに関連する用語 (4件)： 細胞応答 ,  不均一性 ,  Booleネットワーク ,  安定化