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J-GLOBAL ID：201902217951997550   整理番号：19A2706917

異なる土壌と気候条件で栽培されたサツマイモ(Ipomoea batatas)の内生細菌群集のメタゲノム研究【JST・京大機械翻訳】

Metagenomic study of endophytic bacterial community of sweet potato (Ipomoea batatas) cultivated in different soil and climatic conditions

著者 (9件)： Puri Ramesh Raj (The United Graduate School of Agricultural Sciences, Tottori University, Tottori, Japan) ,  Adachi Fumihiko (Faculty of Life and Environmental Science, Shimane University, Matsue, Shimane, Japan) ,  Omichi Masayuki (Department of Agricultural Science and Business, Takushoku University, Hokkaido College, Fukagawa, Hokkaido, Japan) ,  Saeki Yuichi (Faculty of Agriculture, University of Miyazaki, Miyazaki, Japan) ,  Yamamoto Akihiro (Faculty of Agriculture, University of Miyazaki, Miyazaki, Japan) ,  Hayashi Shohei (Faculty of Life and Environmental Science, Shimane University, Matsue, Shimane, Japan) ,  Ali Md Arshad (Institute of Biotechnology, College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou, China) ,  Itoh Kazuhito (The United Graduate School of Agricultural Sciences, Tottori University, Tottori, Japan) ,  Itoh Kazuhito (Faculty of Life and Environmental Science, Shimane University, Matsue, Shimane, Japan)
資料名： World Journal of Microbiology and Biotechnology  (World Journal of Microbiology and Biotechnology)
巻： 35  号： 11  ページ： 1-8  発行年： 2019年 
JST資料番号： W5024A  ISSN： 1573-0972  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,ロックされた核酸オリゴヌクレオチド-PCRクランプ技術とメタゲノム分析を適用することによって,サツマイモ細菌内生植物の群落構造に及ぼす土壌と気候条件の影響を明らかにすることであった。この目的のために,3つの場所の土壌試料を互いに移し,同じ農場からのサツマイモ苗木を約3か月間栽培した。色素体,ミトコンドリアおよび未定義配列の除去後,試料当たりの保持配列および操作分類単位の平均数は,それぞれ,20,891および846であった。Proteobacteria(85.0%),Bacteroidetes(6.6%)およびActinobacteria(6.3%)が3つの最も優勢な門であり,readsの97.9%を占め,γ-Proteobacteria(66.3%)が最も豊富であった。トップ10属は,Pseudomonasが最も優性である全体的な読み取りの81.2%を占めた。全体的な内部寄生細菌群集は試料間で類似しており,土壌と気候条件は全内部寄生生物群集に大きく影響しないことを示した。元の内部寄生細菌群集は栽培期間中に維持される可能性がある。Copyright 2019 Springer Nature B.V. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 優性 ,  *サツマイモ ,  *気象条件 ,  ミトコンドリア ,  *栽培 ,  農場 ,  *細菌 ,  オリゴヌクレオチド ,  Pseudomonas
準シソーラス用語： *細菌群集 ,  放線菌門 ,  バクテロイデス門 ,  プロテオバクテリア ,  *メタゲノム ,  *内生細菌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： サツマイモ ,  内生細菌 ,  微生物群集 ,  ロック核酸 ,  メタゲノミクス

分類 (2件)： 土壌生物  (FB04050N) ,  微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (9件)： 土壌 ,  気候条件 ,  栽培 ,  サツマイモ ,  Ipomoea ,  内生細菌 ,  群集 ,  メタゲノム ,  研究