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J-GLOBAL ID：201902220002926579   整理番号：19A2680553

ブタサポウイルス遺伝子型(G)XおよびGXIの完全ゲノム配列決定および遺伝的特性化:GVI,GVII,GXおよびGXIサポウイルスは共通のゲノム特徴を共有し,ユニークなブタSAVクレードを形成する【JST・京大機械翻訳】

Complete genome sequencing and genetic characterization of porcine sapovirus genogroup (G) X and GXI: GVI, GVII, GX, and GXI sapoviruses share common genomic features and form a unique porcine SaV clade

著者 (16件)： Sunaga Fujiko (School of Veterinary Medicine, Azabu University, Sagamihara, Kanagawa 252-5201, Japan) ,  Masuda Tsuneyuki (Kurayoshi Livestock Hygiene Service Center, Kurayoshi, Tottori 683-0017, Japan) ,  Aoki Hiroshi (Faculty of Veterinary Science, Nippon Veterinary and Life Science University, Musashino, Tokyo 180-8602, Japan) ,  Ito Mika (Ishikawa Nanbu Livestock Hygiene Service Center, Kanazawa, Ishikawa 920-3101, Japan) ,  Sano Kaori (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Sano Kaori (Department of Pathology, National Institute of Infectious Diseases, Shinjuku, Tokyo 162-0052, Japan) ,  Naoi Yuki (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Katayama Yukie (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Omatsu Tsutomu (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oba Mami (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Furuya Tetsuya (Cooperative Department of Veterinary Medicine, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Shirai Junsuke (Cooperative Department of Veterinary Medicine, Faculty of Agriculture, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Mizutani Tetsuya (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan) ,  Oka Tomoichiro (Department of Virology II, National Institute of Infectious Diseases, Musashimurayama, Tokyo 208-0011, Japan) ,  Nagai Makoto (School of Veterinary Medicine, Azabu University, Sagamihara, Kanagawa 252-5201, Japan) ,  Nagai Makoto (Research and Education Center for Prevention of Global Infectious Disease of Animal, Tokyo University of Agriculture and Technology, Fuchu, Tokyo 183-8509, Japan)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 75  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サポウイルス(SaVs)は,ブタを含むヒトおよび動物に感染するファミリーCaliciviridaeに属する腸内ウイルスである。今日まで,SaVsは完全なVP1配列に基づいて19のgenogroups(G)に分類されている。しかしながら,いくつかのSaV Gsの完全なゲノム配列はまだ利用できない。本研究において,著者らは4つのSaVs(2つのGXと2つのgxi SaVs)の完全ゲノム配列を決定し,それらを他のSaVsのそれらと一緒に分析した。ポリ(A)尾部を除くGXおよびgxi SaVsの完全ゲノム配列は,ブタGVIおよびGVIIウイルスを除いて,他のSaVsのそれらより短い7124,7142,7170および7179ヌクレオチドであった。遺伝的特性化により,GX SaVsおよびgxi SaVsは,ORF1コード領域の最初の10アミノ酸残基,他の遺伝子型のそれより短いORF1,および非構造蛋白質/構造蛋白質接合の5′末端の予測二次構造のようなGVIおよびGVIIウイルスと共通の特徴を共有することを明らかにした。系統発生分析は,GXおよびgxi SaVsがブタGVI,GVIIおよびGix SaVsと分岐し,ブタSaVsのみから成るクレードを形成することを示した。これらの知見は,ブタのGXとgxi SaVsがブタのGVI,GVII,およびおそらくGix SaVsと共に,ブタ個体群の共通祖先から進化したことを示唆する。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 二次構造 ,  カリシウイルス科 ,  個体群 ,  *ゲノム ,  ヒト ,  動物 ,  アミノ酸残基 ,  ヌクレオチド ,  *遺伝子型 ,  予測 ,  エンテロウイルス
準シソーラス用語： 系統解析 ,  *クレード ,  *サポウイルス ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 完全ゲノム配列決定 ,  遺伝子型 ,  遺伝子型 ,  ブタ ,  Sapovirus

分類 (1件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (9件)： ブタ ,  サポウイルス ,  遺伝子型 ,  ゲノム配列 ,  遺伝的特性化 ,  GX ,  ゲノム ,  共有 ,  クレード