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J-GLOBAL ID：201902220413813421   整理番号：19A1643008

細菌からの非リン酸化性D-アラビノース,糖酸,L-ガラクトースおよびL-フコース経路に関与するD-アルトロネート・デヒドラターゼファミリー蛋白質の基質および代謝的混乱【JST・京大機械翻訳】

Substrate and metabolic promiscuities of d-altronate dehydratase family proteins involved in non-phosphorylative d-arabinose, sugar acid, l-galactose and l-fucose pathways from bacteria

著者 (6件)： Watanabe Seiya (Department of Bioscience, Graduate School of Agriculture, Ehime University, 3-5-7 Tarumi, Matsuyama, Ehime, 790-8566, Japan) ,  Watanabe Seiya (Faculty of Agriculture, Ehime University, 3-5-7 Tarumi, Matsuyama, Ehime, 790-8566, Japan) ,  Watanabe Seiya (Center for Marine Environmental Studies, Ehime University, 2-5 Bunkyo-cho, Matsuyama, Ehime, 790-8577, Japan) ,  Fukumori Fumiyasu (Faculty of Food and Nutritional Sciences, Toyo University, 1-1-1 Izumino, Itakura-machi, Ora-gun, Gunma, 374-0193, Japan) ,  Watanabe Yasuo (Department of Bioscience, Graduate School of Agriculture, Ehime University, 3-5-7 Tarumi, Matsuyama, Ehime, 790-8566, Japan) ,  Watanabe Yasuo (Faculty of Agriculture, Ehime University, 3-5-7 Tarumi, Matsuyama, Ehime, 790-8566, Japan)
資料名： Molecular Microbiology  (Molecular Microbiology)
巻： 112  号： 1  ページ： 147-165  発行年： 2019年 
JST資料番号： T0455A  ISSN： 0950-382X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 微生物ゲノムにおける遺伝子文脈は,潜在的基質を同定するためのかなりの助けとなる。Herbaspirillum huttiense IAM 15032におけるC785_RS13685遺伝子は,D-アルトロニートデヒドラターゼ蛋白質ファミリーのメンバーであり,in vitroでd-アラビノネートデヒドラターゼとして機能する,推定ペントース代謝に関連する遺伝子とクラスター化される。本研究において,さらなる生化学的特性化と遺伝子発現分析は,L-キシロン酸が非リン酸化経路のいわゆるルートIIを介して最終的にα-ケトグルタル酸に変換される生理学的基質であることを明らかにした。C785_RS13685の基質であるD-アルトロン酸,D-イドロナートおよびL-グルコン酸を含むいくつかのヘキソナートもC785_RS13685を含む遺伝子クラスタを有意にアップレギュレーションし,ピルビン酸およびd-またはL-グリセリン酸が最終的に生成される可能性を示唆した。反対に,C785_RS13685に対する相同遺伝子,Acidovorax avenae ATCC 19860のACAv_RS08155は,L-ガラクトナートが2つのデヒドロゲナーゼの逐次活性によりC5位置でエピマー化され,D-アルトロン酸を生成した。さらに,この経路は非燐酸化L-フコース経路のルートIIIと完全に重複した。D-アルトロニートデヒドラターゼ蛋白質の基質の有望性は,D-アラビノース,糖酸,L-フコース及びL-ガラクトース経路において,「代謝的約束」に著しく拡張されている。Copyright 2019 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *リン酸化 ,  *基質 ,  *細菌 ,  エピマー化 ,  *タンパク質 ,  クラスタ化 ,  ペントース ,  遺伝子 ,  遺伝子発現 ,  *代謝 ,  脂肪族ケトン ,  脂肪族カルボン酸 ,  ケト酸 ,  ジカルボン酸
準シソーラス用語： Acidovorax avenae ,  Herbaspirillum , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 酵素生理  (EG03052C) ,  生物学的機能  (EB03040U)

物質索引 (3件)： D-アラビノース ,  L-グリセリン酸 ,  α-ケトグルタル酸

タイトルに関連する用語 (11件)： 細菌 ,  リン酸化 ,  D-アラビノース ,  糖酸 ,  L-ガラクトース ,  L-フコース ,  経路 ,  蛋白質 ,  基質 ,  代謝 ,  混乱