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J-GLOBAL ID：201902223431989563   整理番号：19A1565044

日本の霧島地域における温泉水のメタゲノム解析により明らかにされた微生物群集構造と環境パラメータとの関係【JST・京大機械翻訳】

The Relationship Between Microbial Community Structures and Environmental Parameters Revealed by Metagenomic Analysis of Hot Spring Water in the Kirishima Area, Japan

著者 (10件)： Nishiyama Eri (Biotechnological Research Support Division, FASMAC Co. Ltd, Kanagawa, Japan) ,  Nishiyama Eri (Department of Biological Information, Tokyo Institute of Technology, Tokyo, Japan) ,  Higashi Koichi (Center for Information Biology, National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan) ,  Mori Hiroshi (Center for Information Biology, National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan) ,  Suda Konomi (Institute for Geo-Resources and Environment, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Ibaraki, Japan) ,  Nakamura Hitomi (Department of Solid Earth Geochemistry, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, Yokosuka, Japan) ,  Omori Soichi (Faculty of Liberal Arts, The Open University of Japan, Chiba, Japan) ,  Maruyama Shigenori (Department of Earth and Planetary Sciences, Tokyo Institute of Technology, Tokyo, Japan) ,  Hongoh Yuichi (School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology, Tokyo, Japan) ,  Kurokawa Ken (Center for Information Biology, National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan)
資料名： Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web)  (Frontiers in Bioengineering and Biotechnology (Web))
巻： 6  ページ： 202  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7059A  ISSN： 2296-4185  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多様な微生物は温泉や深海熱水噴出のような極端な環境に特異的に生息する。微生物群集構造は,このような極端な環境の環境因子特性に基づいて予測可能であるという仮説を検証するために,多様な化学的性質を持つ温泉が比較的狭い地域に分布しているK島地域の9つの温泉からの水サンプルのメタゲノムと61タイプの物理化学データを用いて,微生物分類群/機能と環境因子の相関分析を行った。著者らのメタゲノム分析は,試料が門のCrenarchaeotaか門のAquifiaeのどちらかによって支配される2つの主要なタイプに分類できることを明らかにした。相関分析は,Crenarchaeotaが高濃度のイオンと全炭素を含む栄養素に富む環境で優勢であることを示したが,Aquifiaeは低イオン濃度の栄養不良環境で優勢であった。これらの環境因子は,CrenarchaeotaまたはAquifiaeの豊度を予測するために構築された一般化線形モデルにおける重要な説明変数であった。遺伝子の機能的濃縮分析も,2つの主要なタイプの分離が主に独立栄養炭素固定,硫酸塩代謝および硝酸塩還元に関与する遺伝子に起因することを明らかにした。著者らの結果は,AquificaeとCrenarchaeotaが,それぞれの環境に適応するそれらの代謝経路を通して,K島温泉水生態系において重要な役割を果たすことを示唆した。著者らの知見は,環境パラメータから温泉における微生物群集構造を予測するための基礎を提供し,また極端な環境における生物学的資源の探査に対する手掛かりを提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： イオン ,  独立栄養 ,  代謝経路 ,  遺伝子 ,  深海 ,  硫酸塩 ,  生態系 ,  予測 ,  栄養素 ,  *温泉 ,  *微生物 ,  *メタゲノム ,  環境因子 ,  *微生物群集構造 ,  クレン古細菌門
準シソーラス用語： Crenarchaeota , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 極端な環境 ,  環境パラメータ ,  微生物 ,  メタゲノム ,  温泉

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y)

引用文献 (48件)：

• Aho K., Derryberry D., Peterson T. (2014). Model selection for ecologists: the worldview of AIC and BIC. Ecology 95, 631-636. doi: 10.1890/13-1452.1
• Aoshima M., Ishii M., Igarashi Y. (2004). A novel enzyme, citryl-CoA lyase, catalysing the second step of the citrate cleavage reaction in Hydrogenobacter thermophilus TK-6. Mol. Microbiol. 52, 763-770. doi: 10.1111/j.1365-2958.2004.04010.x
• Brazelton W. J., Nelson B., Schrenk M. O. (2012). Metagenomic evidence for h(2) oxidation and h(2) production by serpentinite-hosted subsurface microbial communities. Front. Microbiol. 2:268. doi: 10.3389/fmicb.2011.00268
• Brunet R. C., Garcia-Gil L. J. (1996). Sulfide-induced dissimilatory nitrate reduction anaerobic freshwater sediments. FEMS Microbiol. Ecol. 21, 131-138. doi: 10.1111/j.1574-6941.1996.tb00340.x
• Castelino M., Eyre S., Moat J., Fox G., Martin P., Ho P., et al. (2017). Optimisation of methods for bacterial skin microbiome investigation: primer selection and comparison of the 454 versus MiSeq platform. BMC Microbiol. 17:23. doi: 10.1186/s12866-017-0927-4

タイトルに関連する用語 (8件)： 日本 ,  霧島 ,  地域 ,  温泉水 ,  メタゲノム解析 ,  微生物群集構造 ,  環境 ,  パラメータ