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J-GLOBAL ID：201902226817277643   整理番号：19A1589581

エチオピアの土着ヒツジにおける脂肪沈着と尾部形態に関連するゲノムワイド変異,候補領域および遺伝子【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Variation, Candidate Regions and Genes Associated With Fat Deposition and Tail Morphology in Ethiopian Indigenous Sheep

著者 (16件)： Ahbara Abulgasim (School of Life Sciences, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom) ,  Ahbara Abulgasim (Department of Zoology, Faculty of Sciences, Misurata University, Misurata, Libya) ,  Bahbahani Hussain (Department of Biological Sciences, Faculty of Science, Kuwait University, Safat, Kuwait) ,  Almathen Faisal (Department of Veterinary Public Health and Animal Husbandry, College of Veterinary Medicine, King Faisal University, Al-Ahsa, Saudi Arabia) ,  Al Abri Mohammed (Department of Animal and Veterinary Sciences, College of Agriculture and Marine Sciences, Sultan Qaboos University, Muscat, Oman) ,  Agoub Mukhtar Omar (Agricultural Research Center, Misurata, Libya) ,  Abeba Ayelle (Debre Berhan Research Centre, Debre Berhan, Ethiopia) ,  Kebede Adebabay (Amhara Regional Agricultural Research Institute, Bahir Dar, Ethiopia) ,  Kebede Adebabay (LiveGene, International Livestock Research Institute, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Musa Hassan Hussein (Faculty of Medical Laboratory Sciences, University of Khartoum, Khartoum, Sudan) ,  Mastrangelo Salvatore (Dipartimento di Scienze Agrarie e Forestali, Viale delle Scienze, Universita Palermo, Palermo, Italy) ,  Pilla Fabio (Dipartimento Agricoltura, Ambiente e Alimenti, Universita degli Studi del Molise, Campobasso, Italy) ,  Ciani Elena (Dipartimento di Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica, Universita degli Studi di Bari “Aldo Moro ”, Bari, Italy) ,  Hanotte Olivier (School of Life Sciences, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom) ,  Hanotte Olivier (LiveGene, International Livestock Research Institute, Addis Ababa, Ethiopia) ,  Mwacharo Joram M. (Small Ruminant Genomics, International Center for Agricultural Research in the Dry Areas (ICARDA), Addis Ababa, Ethiopia)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 9  ページ： 699  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 体重の変化と体脂肪の分布は飼料の利用可能性,体温調節およびエネルギー貯蔵と関連している。エチオピアは,古代起源の異なる農業生態学的および人間的な農民の多様性によって特徴付けられ,それはその土着の家畜の変異に影響を及ぼした。ここでは,Illina Ovine 50K SNP BeadChipアッセイを用いて,11種のエチオピア固有ヒツジ個体群の常染色体の全ゲノムプロファイルを調べた。カリブ海,ヨーロッパ,中東,中国,および西部,北部および南部アフリカからのヒツジは,地球規模,遺伝的変異およびエチオピア個体群の歴史を扱うために含まれた。個体群関係と構造分析は,それらの北アフリカと中東の対応物からエチオピア固有の脂肪尾ヒツジを分離した。これは2つの主な遺伝的背景を示し,アフリカの脂肪尾部ヒツジに対する2つの異なる遺伝的歴史を支持する。エチオピアヒツジの中で,著者らの結果は,短い脂肪尾部ヒツジが単系統群を代表しないことを示している。4つの遺伝的背景はエチオピア固有ヒツジに存在するが,西と南エチオピアからの脂肪と長い脂肪尾ヒツジの間で異なる割合で存在する。エチオピアのfat ヒツジは,スーダンの薄い尾のヒツジと遺伝的背景を共有している。全ゲノム選択シグネチャ分析により,成長形質と脂肪沈着(NPR2,HINT2,SPAG8,INSR),四肢と骨格の発達,および尾部形成(ALX4,HOXB13,BMP4),腱の発生と形態(RXFP2),および熱ストレス(DNAJC18)への応答に影響を及ぼす8つの推定候補領域が同定された(EYA2,HOXB13,BMP4),胚発生,骨と軟骨の発達(EYA2),体重と高さ変化(DIS3L2),horの発生と形態(RXFP2),および熱ストレスに対する応答(DNAJC18)。著者らの知見は,エチオピアの脂肪尾部ヒツジが,骨格の成長,脂肪代謝および関連する生理学的プロセスの遺伝的制御を理解するための重要な資源を提示する独自に混合されているが異なる遺伝子プールを表すことを示唆する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 家畜 ,  アフリカ ,  脂質代謝 ,  常染色体 ,  *変異 ,  遺伝的調節 ,  ヨーロッパ ,  *エチオピア連邦民主共和国 ,  暑熱ストレス ,  *形態 ,  体重 ,  中東 ,  *遺伝子 ,  個体群 ,  *遺伝

著者キーワード (5件)： 混和剤 ,  アフリカ ,  脂肪尾部 ,  Ovis ,  薄い尾

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

引用文献 (71件)：

• Alexander D. H., Novembre J., Lange K. (2009). Fast model-based estimation of ancestry ain unrelated individuals. Genome Res. 19, 1655-1664. doi: 10.1101/gr.094052.109
• Assefa F., Tigistu T., Lambebo A. (2015). Assessment of the production system, major constraints and opportunities of sheep production in doyogena woreda, kembata tambaro zone, southern ethiopia. J Biol Agric Healthc. 5, 37-41. Available online at: https://iiste.org/Journals/index.php/JBAH/article/view/27068 doi: 10.1101/gr.094052.109
• Astuti D., Morris M. R., Cooper W. N., Staals R. H., Wake N. C., Fews G. A. (2012). Germline mutations in DIS3L2 cause the Perlman syndrome of overgrowth and Wilms tumor susceptibility. Nat. Genet. 44, 277-284. doi: 10.1038/ng.1071
• Atti N., Bocquier F., Khaldi G. (2004). Performance of the fat-tailed Barbarine sheep in its environment: adaptive capacity to alternation of underfeeding and re-feeding periods. Rev. Anim. Res. 53, 165-176. doi: 10.1051/animres:2004012
• Bahbahani H., Clifford H., Wragg D., Mbole-Kariuki M. N., Van Tassell C., Sonstegard T., et al. (2015). Signatures of positive selection in East African Shorthorn Zebu: a genome-wide single nucleotide polymorphism analysis. Sci. Rep. 5:11729. doi: 10.1038/srep11729

タイトルに関連する用語 (8件)： エチオピア ,  ヒツジ ,  脂肪沈着 ,  尾部 ,  形態 ,  ゲノム ,  変異 ,  遺伝子