文献

J-GLOBAL ID：201902227346355888   整理番号：19A2515887

ロシアにおけるSolanum tuberosumから分離したジャガイモウイルスPの分岐株の完全ゲノム配列【JST・京大機械翻訳】

Complete genome sequence of a divergent strain of potato virus P isolated from Solanum tuberosum in Russia

著者 (6件)： Yanagisawa Hironobu (Central Region Agricultural Research Center, National Agriculture and Food Research Organization, Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Matsushita Yosuke (Institute of Vegetable and Floriculture Science, National Agriculture and Food Research Organization, Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Khiutti Aleksandr (Federal State Budget Scientific Institution “All-Russian Institute of Plant Protection” (FSBSI VIZR), Saint-Petersburg, Russia) ,  Mironenko Nina (Federal State Budget Scientific Institution “All-Russian Institute of Plant Protection” (FSBSI VIZR), Saint-Petersburg, Russia) ,  Ohto Yasuo (Central Region Agricultural Research Center, National Agriculture and Food Research Organization, Tsukuba, Ibaraki, Japan) ,  Afanasenko Olga (Federal State Budget Scientific Institution “All-Russian Institute of Plant Protection” (FSBSI VIZR), Saint-Petersburg, Russia)
資料名： Archives of Virology  (Archives of Virology)
巻： 164  号： 11  ページ： 2891-2894  発行年： 2019年 
JST資料番号： A0324C  ISSN： 0304-8608  CODEN： ARVIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Carlavirus属に属するジャガイモウイルスP(PVP)に対する配列類似性を持つコンティグを,2018年に,Surhe,Artyom,Primorskiy Krai(ロシア)の農民のジャガイモ生産圃場から収集したジャガイモ塊茎におけるハイスループット配列解析により同定した。このウイルスの完全ゲノム配列は,ポリ(A)尾部を除いて,8394ヌクレオチドから成った。これは南アメリカで検出されたPVPの最初の報告である。分離株は,ArgentinaとブラジルからのPVP分離株と高い配列類似性を持っていたが,RNA依存RNAポリメラーゼ(69%ヌクレオチド配列同一性と80%アミノ酸配列同一性)とコート蛋白質(78%ヌクレオチド配列同一性と89%アミノ酸配列同一性)をコードする遺伝子では低配列類似性が観察された。系統発生分析は,このPVP様ウイルスが既知のPVP分離株とクラスター化するが,それらとは異なることを明らかにした。ICTVの分類基準を用いた配列の比較は,このPVP様ウイルスがPVPの株であることを示した。Copyright 2019 Springer-Verlag GmbH Austria, part of Springer Nature Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RNAポリメラーゼ ,  クラスタ化 ,  *ロシア連邦 ,  遺伝子 ,  *ジャガイモ ,  RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド ,  ブラジル連邦共和国 ,  塊茎 ,  分離株 ,  コンティグ ,  *ゲノム配列 ,  農業従事者 ,  カーラウイルス属 ,  改変
準シソーラス用語： 農民 ,  Argentina ,  カーラウイルス , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルスの生化学  (EG04030F)

タイトルに関連する用語 (7件)： ロシア ,  Solanum ,  ジャガイモ ,  ウイルス ,  分岐 ,  株 ,  ゲノム配列