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J-GLOBAL ID：201902227496265782   整理番号：19A1651633

統合分析による乳癌からの骨転移を伴う相関遺伝子とシグナル伝達経路の探索【JST・京大機械翻訳】

Seeking for Correlative Genes and Signaling Pathways With Bone Metastasis From Breast Cancer by Integrated Analysis

著者 (3件)： Zhang Yu (Department of Orthopaedics, The First People’s Hospital of Chengdu, Chengdu, China) ,  He Wendan (Department of Stomatology, Shenzhen Hospital, Southern Medical University, Shenzhen, China) ,  Zhang Sen (State Key Laboratory of Bioactive Substances and Functions of Natural Medicines, Institute of Materia Medica, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, Beijing, China)
資料名： Frontiers in Oncology (Web)  (Frontiers in Oncology (Web))
巻： 9  ページ： 138  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7089A  ISSN： 2234-943X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:骨転移は進行乳癌患者でしばしば起こり,乳癌関連死亡の主要原因の1つである。本研究の目的は,乳癌骨転移の病態生理における潜在的遺伝子と関連するシグナル伝達経路を同定することである。【方法】乳癌骨転移のための3つのmRNA発現データセットを,遺伝子発現オムニバス(GEO)データセットから得た。差次的に発現した遺伝子(DEG)を得た。機能解析,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワーク,転写因子(TF)-標的遺伝子ネットワークを構築した。臨床標本を用いたリアルタイムPCRを実施し,統合分析からの結果を正当化した。結果:749のDEGが得られた。破骨細胞分化と関節リウマチは,乳癌の骨転移におけるDEGのための2つの有意に豊かなシグナル伝達経路であった。Smad7(程度=10),TGFBR2(程度=9),VIM(程度=8),FOS(程度=8),PDGFRB(程度=7),COL5A1(程度=6),Arrb2(程度=6),ITGAV(程度=6)はPPIネットワークにおいて高度の遺伝子であった。Ets1(程度=12),SPI1(程度=12),FOS(程度=10),FLI1(程度=5),KLF4(程度=4),JUNB(程度=4),NR3C1(程度=4)は,TFs-標的遺伝子ネットワークにおける高度遺伝子であった。QRT-PCRにより検証され,IBSP,MMP9,MMP13,TNFAIP6,CD200,DHRS3,ASS1,RIPK4,VIM,およびPROM1の発現レベルは,著者らの統合分析とほぼ一致した。PROM1を除いて,他の遺伝子は乳癌骨転移の診断値を有していた。結論:同定されたDEGとシグナル伝達経路は,乳癌からの骨転移の病理学的機序を理解するために貢献する可能性がある。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  死 ,  関節リウマチ ,  ヒト ,  診断 ,  *乳房腫瘍 ,  タンパク質 ,  病態生理 ,  転写因子 ,  遺伝子発現 ,  *遺伝子
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  mRNA発現 ,  乳癌骨転移 ,  *伝達経路 ,  *骨転移 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 乳癌 ,  骨転移 ,  診断 ,  mRNA発現プロファイル ,  蛋白質-蛋白質相互作用 ,  転写因子-標的遺伝子

分類 (2件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (54件)：

• Adams S, Munz B. RIP4 is a target of multiple signal transduction pathways in keratinocytes: implications for epidermal differentiation and cutaneous wound repair. Exp Cell Res. (2010) 316:126-37. doi: 10.1016/j.yexcr.2009.10.006
• Zheng R, Zeng H, Zhang S, Chen T, Chen W. National estimates of cancer prevalence in China, 2011. Cancer Lett. (2016) 370:33-8. doi: 10.1016/j.canlet.2015.10.003
• Graham N, Qian BZ. Mesenchymal stromal cells: emerging roles in bone metastasis. Int J Mol Sci. (2018) 19:E1121. doi: 10.3390/ijms19041121
• Coleman RE. The role of bisphosphonates in breast cancer. Breast. (2004) 13:19-28. doi: 10.1016/j.breast.2004.09.004
• Braun S, Vogl FD, Naume B, Janni W, Osborne MP, Coombes RC, et al. A pooled analysis of bone marrow micrometastasis in breast cancer. N Engl J Med. (2005) 353:793-802. doi: 10.1056/NEJMoa050434

タイトルに関連する用語 (8件)： 統合 ,  分析 ,  乳癌 ,  骨転移 ,  相関 ,  遺伝子 ,  シグナル伝達経路 ,  探索