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J-GLOBAL ID：201902230704082356   整理番号：19A2813526

次世代シーケンサーデータの解析手法 第14回 RNA-seq解析(その2)

Methods for analyzing next-generation sequencing data XIV. RNA-seq analysis (Part 2)

著者 (5件)： 寺田朋子 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  清水謙多郎 (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構) ,  門田幸二 (東大 大学院農学生命科学研究科) ,  門田幸二 (東大 微生物科学イノベーション連携研究機構)
資料名： 日本乳酸菌学会誌  (Japanese Journal of Lactic Acid Bacteria)
巻： 30  号： 3  ページ： 153-161  発行年： 2019年11月13日 
JST資料番号： L3534A  ISSN： 1343-327X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： Lactobacillus rhamnosus GGの酸スト...

シソーラス用語： *ヌクレオチド配列 ,...
準シソーラス用語： *乳酸桿菌属 ,...

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分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (17件)：

• 1) 寺田朋子,坂本光央,清水謙多郎,門田幸二(2019)次世代シーケンサーデータの解析手法:第 13 回 RNA-seq 解析(その1).日本乳酸菌学会誌 30: 38-45.
• 2) Kankainen M, Paulin L, Tynkkynen S, von Ossowski I, Reunanen J, et al. (2009) Comparative genomic analysis of Lactobacillus rhamnosus GG reveals pili containing a human- mucus binding protein. Proc Natl Acad Sci U S A 106: 17193-17198.
• 3) Bang M, Yong CC, Ko HJ, Choi IG, Oh S. (2018) Transcriptional Response and Enhanced Intestinal Adhesion Ability of Lactobacillus rhamnosus GG after Acid Stress. J Microbiol Biotechnol 28: 1604-1613.
• 4) Toribio AL, Alako B, Amid C, Cerdeño-Tarrága A, Clarke L, et al. (2017) European Nucleotide Archive in 2016. Nucleic Acids Res 45: D32-D36.
• 5) Afgan E, Baker D, van den Beek M, Blankenberg D, Bouvier D, et al. (2016) The Galaxy platform for accessible, reproducible and collaborative biomedical analyses: 2016 update. Nucleic Acids Res 44: W3-W10.

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シーケンサー ,  解析手法 ,  RNA-seq ,  解析