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J-GLOBAL ID：201902237576933727   整理番号：19A2479587

ヒト以外の動物種を対象としたNGSによるMHCタイピング法

Non-human MHC genotyping methods using next generation sequencing

著者 (3件)： 谷本幸介 (東京医科歯科大学 難治疾患研究所 ゲノム解析室) ,  成瀬妙子 (東京医科歯科大学 難治疾患研究所 分子病態分野) ,  木村彰方 (東京医科歯科大学 難治疾患研究所 分子病態分野)
資料名： MHC (Web)  (MHC (Web))
巻： 26  号： 2  ページ： 115-123(J-STAGE)  発行年： 2019年 
JST資料番号： U0437A  ISSN： 2187-4239  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 次世代シークエンサー(NGS)によるヒト以外の動物種のMHC...

シソーラス用語： *組織適合性遺伝子 ,...

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著者キーワード (6件)： 次世代シークエンサー(NGS) ,  MHCタイピング ,  バイオインフォマティクス ,  next generation sequencing (NGS) ,  MHC genotyping ,  bioinformatics

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (20件)：

• 1) Bontrop RE: Comparative genetics of MHC polymorphisms in different primate species: duplications and deletions. Hum Immunol 67, 388-397, doi:10.1016/j.humimm.2006.03.007 (2006).
• 2) Stuglik MT, Radwan J, Babik W: jMHC: software assistant for multilocus genotyping of gene families using next-generation amplicon sequencing. Mol Ecol Resour 11, 739-742, doi:10.1111/j.1755-0998.2011.02997.x (2011).
• 3) Edgar RC: MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Res 32, 1792-1797, doi:10.1093/nar/gkh340 (2004).
• 4) Shiina T, Yamada Y, Aarnink A, et al.: Discovery of novel MHC-class I alleles and haplotypes in Filipino cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) by pyrosequencing and Sanger sequencing: Mafa-class I polymorphism. Immunogenetics 67, 563-578, doi:10.1007/s00251-015-0867-9 (2015).
• 5) Galan M, Guivier E, Caraux G, et al.: A 454 multiplex sequencing method for rapid and reliable genotyping of highly polymorphic genes in large-scale studies. BMC Genomics 11, 296, doi:10.1186/1471-2164-11-296 (2010).

タイトルに関連する用語 (4件)： ヒト ,  動物 ,  MHC ,  タイピング