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J-GLOBAL ID:201902238469025277   整理番号:19A1804555

質量分析代謝ミクスデータからの偽陽性および偽陰性化合物同定を低減するための一歩前進:抽出イオンクロマトグラムの構築のための新しいアルゴリズムとクロマトグラフィーピークの検出【JST・京大機械翻訳】

One Step Forward for Reducing False Positive and False Negative Compound Identifications from Mass Spectrometry Metabolomics Data: New Algorithms for Constructing Extracted Ion Chromatograms and Detecting Chromatographic Peaks
著者 (5件):
資料名:
巻: 89  号: 17  ページ: 8696-8703  発行年: 2017年 
JST資料番号: A0395A  ISSN: 0003-2700  CODEN: ANCHAM  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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抽出イオンクロマトグラム(EIC)から検出された偽陽性及び偽陰性ピークは,非標的液体又はガスクロマトグラフィー-質量分析メタボロミクスデータを前処理する既存のソフトウェアパッケージによる緊急問題である。EICの逐次構築とEICピークの検出を行う新しいアルゴリズムを開発した。新しいアルゴリズムを2つのポピュラーなソフトウェアパッケージXCMSとMZM2に比較し,これらの新しいアルゴリズムが有意に少ない偽陽性を検出することを示した。データ中に存在することが知られている化合物の検出に関して,新しいアルゴリズムは少なくともXCMSとMZM2と同様に機能する。さらに,m/zにおける質量耐性は,EICを構築する過程において,ppmにおける質量耐性よりもむしろ有利であることを示した。質量許容パラメータはEIC構築プロセスにおいて重要な役割を果たし,EICピークの検出に大きな影響を与えることができる。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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数値計算  ,  質量分析 
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