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J-GLOBAL ID：201902241585959660   整理番号：19A1806133

小胞体アミノペプチダーゼ1の立体配座変化と触媒機構におけるドメイン間相互作用の重要な役割【JST・京大機械翻訳】

Critical Role of Interdomain Interactions in the Conformational Change and Catalytic Mechanism of Endoplasmic Reticulum Aminopeptidase 1

著者 (8件)： Stamogiannos Athanasios (National Centre for Scientific Research Demokritos, Greece) ,  Maben Zachary (Department of Pathology, University of Massachusetts Medical School, Massachusetts, United States) ,  Papakyriakou Athanasios (National Centre for Scientific Research Demokritos, Greece) ,  Mpakali Anastasia (National Centre for Scientific Research Demokritos, Greece) ,  Kokkala Paraskevi (Laboratory of Organic Chemistry, Department of Chemistry, University of Athens, Greece) ,  Georgiadis Dimitris (Laboratory of Organic Chemistry, Department of Chemistry, University of Athens, Greece) ,  Stern Lawrence J. (Department of Pathology, University of Massachusetts Medical School, Massachusetts, United States) ,  Stratikos Efstratios (National Centre for Scientific Research Demokritos, Greece)
資料名： Biochemistry  (Biochemistry)
巻： 56  号： 10  ページ： 1546-1558  発行年： 2017年 
JST資料番号： B0270B  ISSN： 0006-2960  CODEN： BICHAW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 小胞体アミノペプチダーゼ1(ERAP1)は抗原エピトープの生成と主要組織適合性クラスI制限適応免疫応答に重要な細胞内酵素である。ERAP1は広範囲の異なるペプチドを処理するが,これらの性質の背後にある機構はほとんど理解されていないが,長さと配列選択性を示す。X線結晶学的解析により,ERAP1は,C末端ドメインIVが活性部位ドメインIIに対して近位または遠位である少なくとも2つの異なる立体配座を仮定できることを明らかにした。ERAP1の触媒機構におけるこの立体配座変化の役割の理解を改善するために,ドメインIIとIVの間の重要な塩橋を撹乱する部位特異的変異誘発を用いた。酵素分析により,これらの変異は触媒部位から離れて位置するが,触媒効率を大きく低下させ,アロステリック速度論的挙動を変化させることを明らかにした。変異体は小さなペプチドによりより効率的に活性化され,弱い親和性とより速い解離速度を持つ競合阻害剤に結合した。分子動力学解析は,変異がERAP1の立体配座分布に影響し,閉鎖状態のポピュレーションを減少させることを示唆した。小角X線散乱は,野生型とERAP1変異体の両方が溶液中で主に開放立体配座状態にあることを示した。全体として,ERAP1におけるドメインIIとIV間の静電相互作用は,触媒部位の構造的完全性を調節する立体配座変化を駆動するために重要であることを示唆した。ERAP1におけるドメイン開口の程度はおそらく抗原性ペプチド前駆体に対するその特殊化の根底にあり,阻害剤開発努力において考慮されるべきである。Copyright 2019 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 親和性 ,  *アミノペプチダーゼ ,  変異 ,  部位特異的変異誘発 ,  分子動力学 ,  静電相互作用 ,  活性部位 ,  野生型 ,  *立体配座 ,  *配座転移 ,  ペプチド ,  速度論 ,  エピトープ
準シソーラス用語： 阻害剤 ,  *ドメイン構造 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (6件)： 小胞体 ,  アミノペプチダーゼ ,  立体配座変化 ,  触媒 ,  ドメイン間相互作用 ,  役割