文献

J-GLOBAL ID：201902248838226779   整理番号：19A0494780

Arabidopsis thalianaにおけるArgonaute4関連長鎖非コードRNAの分析はRNA指向性DNAメチル化を介する遺伝子調節への新しい洞察を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Argonaute 4-Associated Long Non-Coding RNA in Arabidopsis thaliana Sheds Novel Insights into Gene Regulation through RNA-Directed DNA Methylation

著者 (3件)： Au Phil Chi Khang (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation Agriculture, Canberra, Australian Capital Territory 2601, Australia) ,  Dennis Elizabeth S. (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation Agriculture, Canberra, Australian Capital Territory 2601, Australia) ,  Wang Ming-Bo (Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation Agriculture, Canberra, Australian Capital Territory 2601, Australia)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 8  ページ： 198  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： RNA指向DNAメチル化(RdDM)は,標的ゲノム遺伝子座を定義する足場として長い非コードRNA(lncRNA)を必要とする植物特異的de novo DNAメチル化機構である。ゲノム安定性の維持におけるRdDMの役割は良く確立されているが,それが蛋白質コード遺伝子をどのように調節するかはほとんど理解されておらず,RdDM標的遺伝子はほとんど同定されていない。本研究では,特にlncRNAと特異的に結合するRdDMの重要な成分であるARGONAUTE4(AGO4)に対する核RNA免疫沈降を用いて,RdDM関連lncRNAの配列を得た。これらのlncRNAとRdDM突然変異体の遺伝子発現データとの比較は,新しいRdDM標的遺伝子を同定した。驚くべきことに,これらの標的遺伝子の大部分はRdDM変異体において抑制され,それらがRdDMにより正常に活性化されることを示唆した。これらのRdDM活性化遺伝子は,RdDM抑制遺伝子よりも遺伝子体lncRNAに富んでいた。いくつかのRdDM活性化ストレス応答遺伝子のヒストン修飾およびRNA分析は,これらの遺伝子の抑制発現にもかかわらず,AGO4変異体のlncRNA重複遺伝子体領域における活性ヒストンマークおよび短いRNA転写物のレベルの増加を検出した。これらの結果は,RdDMまたはAGO4が,潜在的転写を妨げる遺伝子体クロマチン修飾を指示することにより,ストレス応答遺伝子発現の維持または活性化において役割を果たす可能性を示唆する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *RNA【核酸】 ,  *Arabidopsis thaliana ,  *DNA【核酸】 ,  *遺伝的調節 ,  ヒストン ,  免疫沈降反応 ,  *メチル化 ,  ゲノム ,  遺伝子発現
準シソーラス用語： ストレス応答 ,  ヒストン修飾 ,  標的遺伝子 ,  *非翻訳RNA ,  *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： RNA指向性DNAメチル化 ,  AgO4 ,  非コードRNA ,  植物

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (57件)：

• Feng, S.; Jacobsen, S.E.; Reik, W. Epigenetic reprogramming in plant and animal development. Science 2010, 330, 622-627.
• Haag, J.R.; Pikaard, C.S. Multisubunit RNA polymerases IV and V: Purveyors of non-coding RNA for plant gene silencing. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2011, 12, 483-492.
• Wang, M.B.; Dennis, E.S. SPT5-like, a new component in plant RdDM. EMBO Rep. 2009, 10, 573-575.
• Huettel, B.; Kanno, T.; Daxinger, L.; Aufsatz, W.; Matzke, A.J.; Matzke, M. Endogenous targets of RNA-directed DNA methylation and Pol IV in Arabidopsis. EMBO J. 2006, 25, 2828-2836.
• Mosher, R.A.; Schwach, F.; Studholme, D.; Baulcombe, D.C. PolIVb influences RNA-directed DNA methylation independently of its role in siRNA biogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 3145-3150.

タイトルに関連する用語 (8件)： Arabidopsis ,  長鎖非コードRNA ,  分析 ,  RNA ,  指向性 ,  DNAメチル化 ,  遺伝子調節 ,  洞察