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J-GLOBAL ID：201902251004419643   整理番号：19A2239873

CERNAネットワークに基づくColon癌の長い非コードRNA発現署名とそれらの予後値【JST・京大機械翻訳】

Long Noncoding RNA Expression Signatures of Colon Cancer Based on the ceRNA Network and Their Prognostic Value

著者 (8件)： Cheng Yang (Liver Tumor Center, Department of Infectious Diseases and Hepatology Unit, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, Guangdong 510515, China) ,  Cheng Yang (Digestive Department, Guangzhou Women and Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, Guangdong 510623, China) ,  Geng Lanlan (Digestive Department, Guangzhou Women and Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, Guangdong 510623, China) ,  Wang Kunyuan (Liver Tumor Center, Department of Infectious Diseases and Hepatology Unit, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, Guangdong 510515, China) ,  Sun Jingjing (Digestive Department, Guangzhou Women and Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, Guangdong 510623, China) ,  Xu Wanfu (Digestive Department, Guangzhou Women and Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, Guangdong 510623, China) ,  Gong Sitang (Digestive Department, Guangzhou Women and Children’s Medical Center, Guangzhou Medical University, Guangzhou, Guangdong 510623, China) ,  Zhu Yun (Liver Tumor Center, Department of Infectious Diseases and Hepatology Unit, Nanfang Hospital, Southern Medical University, Guangzhou, Guangdong 510515, China)
資料名： Disease Markers  (Disease Markers)
巻： 2019  ページ： Null  発行年： 2019年 
JST資料番号： W1784A  ISSN： 0278-0240  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景.結腸癌におけるceRNAとしての長い非コードRNA(lncRNA)の特異的機能的役割と結腸癌予後に対するそれらの潜在的意味は不明のままである。本研究では,「ceRNA仮説」に基づいて結腸癌における潜在的なlncRNA仲介のceRNA相互作用を調べるために,ゲノム全体の解析を行った。lncRNAの予後値を評価した。方法:統合的計算法を用いてmiRNA調節ネットワークと組み合わせたmiRNA,lncRNAおよびmRNA発現プロファイルに基づいて,調節されないlncRNA関連ceRNAネットワークを構築した。qPCRおよび遺伝子ノックダウン技術を含む分子生物学的技術を用いて,結腸癌の候補標的を検証した。生存分析は,予後的価値を有する候補lncRNAを同定するために実行された。結果.著者らのネットワーク分析は,miRNAとのクロストークを通して機能的ceRNAとしていくつかの新規lncRNAを明らかにした。遺伝子ノックダウン結腸癌細胞と同様に患者組織のQRT-PCR分析は,ceRNAネットワークにおけるトップlncRNAの発現とそれらの標的遺伝子との相関を確認した。機能的濃縮分析は,特異的に発現されたlncRNAが腫瘍進行に関連する広い生物学的機能に関与する可能性があることを予測した。さらに,これらのlncRNAはアポトーシス,PI3K-AKTおよびEGFRシグナル伝達経路を含む一連の細胞経路に関与している可能性がある。生存分析は,ネットワークにおけるいくつかのlncRNAの発現レベルが結腸癌患者の予後と相関していることを示した。結論.本研究は,結腸癌における調節されていないlncRNA関連ceRNAネットワークを明らかにした。結腸癌における同定されたlncRNAの機能を予備的に調査し,それらの潜在的予後価値を評価した。著者らの研究は,lncRNAが結腸癌の発生と進行における重要な調節因子として潜在的に役立つ可能性があることを示した。結腸癌における候補予後lncRNAバイオマーカーを同定した。Copyright 2019 Yang Cheng et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ネットワーク ,  クロストーク ,  アポトーシス ,  バイオマーカー ,  ヒト ,  定量的PCR法 ,  結腸腫瘍 ,  *予後 ,  ゲノム
準シソーラス用語： 調節因子 ,  伝達経路 ,  腫瘍進行 ,  標的遺伝子 ,  マイクロRNA ,  非翻訳長鎖RNA ,  *非翻訳RNA , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (44件)：

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• D. Chakravarty, A. Sboner, S. S. Nair, E. Giannopoulou, R. Li, S. Hennig, J. M. Mosquera, J. Pauwels, K. Park, M. Kossai, T. Y. MacDonald, J. Fontugne, N. Erho, I. A. Vergara, M. Ghadessi, E. Davicioni, R. B. Jenkins, N. Palanisamy, Z. Chen, S. Nakagawa, T. Hirose, N. H. Bander, H. Beltran, A. H. Fox, O. Elemento, M. A. Rubin, "The oestrogen receptor alpha-regulated lncRNA NEAT1 is a critical modulator of prostate cancer," Nature Communications, vol. 5, no. 1, pp. 5383, 2014.

タイトルに関連する用語 (6件)： ceRNA ,  癌 ,  非コードRNA ,  発現 ,  署名 ,  予後値