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J-GLOBAL ID：201902255700450573   整理番号：19A1101160

麻疹ウイルス赤血球凝集素とその受容体のアミノ酸残基間の相互作用エネルギーの計算解析【JST・京大機械翻訳】

Computational Analysis of the Interaction Energies between Amino Acid Residues of the Measles Virus Hemagglutinin and Its Receptors

著者 (7件)： Xu Fengqi (Department of Computational Science, Graduate School of System Informatics, Kobe University, 1-1, Rokkodai, Nada-ku, Kobe, Hyogo 657-8501, Japan) ,  Tanaka Shigenori (Department of Computational Science, Graduate School of System Informatics, Kobe University, 1-1, Rokkodai, Nada-ku, Kobe, Hyogo 657-8501, Japan) ,  Watanabe Hirofumi (Education Center on Computational Science and Engineering, Kobe University, 7-1-48, Minatojima-minamimachi, Chuo-ku, Kobe 650-0047, Japan) ,  Shimane Yasuhiro (Center for Marine Biosciences, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 2-15, Natsushima, Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan) ,  Iwasawa Misako (Center for Earth Information Science and Technology, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 3173-25, Showa-machi, Kanazawa-ku, Yokohama, Kanagawa 236-0001, Japan) ,  Ohishi Kazue (Faculty of Engineering, Tokyo Polytechnic University, 1583, Iiyama, Atsugi, Kanagawa 243-0297, Japan) ,  Maruyama Tadashi (Center for Marine Biosciences, Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, 2-15, Natsushima, Yokosuka, Kanagawa 237-0061, Japan)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 10  号： 5  ページ： 236  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 麻疹ウイルス(MV)はヒトにおいて急性で高度に壊滅的な伝染性疾患を引き起こす。3つのヒト受容体,シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAM),CD46,およびネクチン-4の結晶構造を用いて,MVHのアミノ酸残基とab initioフラグメント分子軌道(FMO)法による受容体の間の結合エネルギーの詳細を計算した。計算されたフラグメント間相互作用エネルギー(IFIEs)は,受容体への結合において必須の役割を果たすMVHの多くの有意に相互作用するアミノ酸残基を明らかにした。以前に報告された実験から予測されたように,MVHのいくつかの重要なアミノ酸残基は一般的であることが示されたが,他は3つの受容体との相互作用に特異的であった。特に,MVHの(非極性)疎水性残基のいくつかは多重受容体と引力的に相互作用することが分かり,分子間相互作用に対する疎水性ポケットの重要性を示した(特にネクチン-4の場合)。対照的に,静電相互作用は特異的分子認識に使用される傾向があった。さらに,アミノ酸変異のin silico実験に対するFMO計算を行い,残基の置換効果に関するウイルス学的実験と合理的な一致を見出した。したがって,本研究は,電子相関FMO法が受容体分子との相互作用に寄与するアミノ酸残基を徹底的に探索する強力なツールであることを示す。それはまた,MVHの阻害剤の設計と癌治療のためのMVsの設計にも適用可能である。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *麻疹ウイルス ,  *計算 ,  *受容体 ,  *アミノ酸残基 ,  分子間相互作用 ,  静電相互作用 ,  結晶構造 ,  分子認識 ,  疎水性 ,  ヒト ,  *血球凝集素 ,  *相互作用 ,  ネクチン ,  *相互作用エネルギー ,  *微生物 ,  *動物ウイルス
準シソーラス用語： *残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 麻疹ウイルス ,  ヘマグルチニン ,  受容体 ,  分子認識 ,  フラグメント分子軌道(FMO)法 ,  IFIE(フラグメント間相互作用エネルギー)

分類 (1件)： ウイルスの生化学  (EG04030F)

引用文献 (40件)：

• Bulter, D. Measles by the numbers: A race to eradication. Nature 2015, 518, 148-149.
• Tatsuo, H.; Ono, N.; Tanaka, K.; Yanagi, Y. SLAM (CDw150) is a cellular receptor for measles virus. Nature 2000, 406, 893-897.
• Schwartzberg, P.L.; Mueller, K.L.; Qi, H.; Cannons, J.L. SLAM receptors and SAP influence lymphocyte interactions, development and function. Nat. Rev. Immunol. 2009, 9, 39-46.
• Tahara, M.; Takeda, M.; Shirogane, Y.; Hashiguchi, T.; Ohno, S.; Yanagi, Y. Measles virus infects both polarized epithelial and immune cells by using distinctive receptor-binding sites on its hemagglutinin. J. Virol. 2008, 82, 4630-4637.
• Noyce, R.S.; Bondre, D.G.; Ha, M.N.; Lin, L.T.; Sisson, G.; Tsao, M.S.; Richardson, C.D. Tumor cell marker PVRL4 (nectin 4) is an epithelial cell receptor for measles virus. PLoS Pathog. 2011, 7, e1002240.

タイトルに関連する用語 (7件)： 麻疹ウイルス ,  赤血球凝集素 ,  受容体 ,  アミノ酸残基 ,  相互作用エネルギー ,  計算 ,  解析