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J-GLOBAL ID：201902256203465319   整理番号：19A0490379

油流出マングローブのメタゲノミクスにより明らかにされた新規多機能β-N-アセチルヘキソサミニダーゼ【JST・京大機械翻訳】

A Novel Multifunctional β-N-Acetylhexosaminidase Revealed through Metagenomics of an Oil-Spilled Mangrove

著者 (15件)： Soares Fabio Lino (Center of Nuclear Energy in Agriculture, University of Sao Paulo, Piracicaba, Sao Paulo 13400-970, Brazil) ,  Soares Fabio Lino (Department of Biology, University of Texas, Arlington, TX 76019, USA) ,  Marcon Joelma (Luiz de Queiroz College of Agriculture, University of Sao Paulo, Piracicaba, Sao Paulo 13418-900, Brazil) ,  Silva Michele de Cassia Pereira e (Luiz de Queiroz College of Agriculture, University of Sao Paulo, Piracicaba, Sao Paulo 13418-900, Brazil) ,  Khakhum Nittaya (Department of Biology, University of Texas, Arlington, TX 76019, USA) ,  Cerdeira Louise Teixeira (Fleury Group, Jabaquara, Sao Paulo, 04344-070, Brazil) ,  Ottoni Julia Ronzella (Center for Chemical, Biological and Agricultural Research (CPQBA), University of Campinas, Campinas, Sao Paulo 13148-218, Brazil) ,  Domingos Daniela Ferreira (Center for Chemical, Biological and Agricultural Research (CPQBA), University of Campinas, Campinas, Sao Paulo 13148-218, Brazil) ,  Taketani Rodrigo Gouvea (Embrapa Environment, Jaguariuna, Sao Paulo 13820-000, Brazil) ,  Oliveira Valeria Maia de (Center for Chemical, Biological and Agricultural Research (CPQBA), University of Campinas, Campinas, Sao Paulo 13148-218, Brazil) ,  Lima Andre Oliveira de Souza (Department of Biological Sciences, University of Vale do Itajai, Itajai, Santa Catarina 88302-202, Brazil) ,  Azevedo Joao Lucio (Luiz de Queiroz College of Agriculture, University of Sao Paulo, Piracicaba, Sao Paulo 13418-900, Brazil) ,  Rodrigues Jorge Luiz Mazza (Department of Land, Air and Water Resources, University of California, Davis, CA 95616, USA) ,  Rodrigues Jorge Luiz Mazza (Environmental Genomics and Systems Biology Division, Lawrence Berkeley National Laboratory, Berkeley, CA 94720, USA) ,  Andreote Fernando Dini (Luiz de Queiroz College of Agriculture, University of Sao Paulo, Piracicaba, Sao Paulo 13418-900, Brazil)
資料名： Bioengineering (Web)  (Bioengineering (Web))
巻： 4  号： 3  ページ： 62  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7144A  ISSN： 2306-5354  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メタゲノミクスのような培養非依存性アプローチの使用は,環境微生物多様性への相補的なアクセスを提供する。マングローブ環境は,特異な機能を見出すための多くの機会を持つ高度に複雑なシステムを代表する。本研究では,加水分解活性を発現するクローンを同定する目的で,油汚染マングローブ部位から得られたホスミドライブラリーの機能的スクリーニングを行った。355アミノ酸と43KDaを有するβ-N-アセチルヘキソサaminidaseをコードする新規遺伝子を検索し,特性化した。翻訳された配列は,Veillonella sp. CAG933のゲノムにおいてβ-N-アセチルヘキソサaminidase遺伝子と38%の類似性を示し,それが新規酵素を構成する可能性があることを示唆した。酵素を発現し,精製し,カルボキシメチルセルロース,p-ニトロフェニル-2アセトアミド-2デオキシ-β-D-グルコピラノシド,p-ニトロフェニル-2アセトアミド-2デオキシ-β-D-ガラクトピラノシド及び4-ニトロフェニルβ-D-グルコピラノシドに対する酵素活性を特性化し,β-N-アセチルグルコサミニダーゼ,β-グルコシダーゼ及びβ-1,4-エンドグルカナーゼ活性を示した。酵素は30°C,pH5.5で最適活性を示した。推定される新規β-N-アセチルグルコサミニダーゼ酵素の特性化は,研究された環境の特性との類似性を反映しており,それはより温和な条件環境とは異なっている。本研究は,新しいバイオテクノロジー製品を得るためのマングローブ微生物に対する培養非依存性分子技術の応用を例証する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  β-グルコシダーゼ ,  カルボキシメチルセルロース ,  クローン ,  培養 ,  セルラーゼ ,  ゲノム ,  酵素活性度 ,  スクリーニング ,  *ヘキソサミニダーゼ ,  Veillonella ,  酵素 ,  *マングローブ
準シソーラス用語： 微生物多様性 ,  *メタゲノミクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： バイオ展望 ,  酵素特性化 ,  ヒドロラーゼ ,  微生物群集 ,  3Dモデリング

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (59件)：

• Holguin, G.; Zamorano, P.G.; De-Bashan, L.E.; Mendoza, R.; Amador, E.; Bashan, Y. Mangrove health in an arid environment encroached by urban development-A case study. Sci. Tot. Environ. 2006, 363, 260-274.
• Andreote, F.D.; Jiménez, D.J.; Chaves, D.; Dias, A.C.F.; Luvizotto, D.M.; Dini-Andreote, F.; Fasanella, C.C.L.; Baena, M.V.; Taketani, R.G.; Melo, I.S. The microbiome of Brazilian mangroves sediments as revealed by metagenomics. PLoS ONE 2012, 7, e38600.
• Leresche, J.; Meyer, H.P. Chemocatalysis and biocatalysis (Biotrasformation): Some thoughts of chemist and of a biothecnologist. Org. Process Res. Dev. 2006, 10, 572-580.
• Soares, F.L., Jr.; Dias, A.C.F.; Fasanella, C.C.; Taketani, R.G.; Lima, A.O.D.S.; Melo, I.S.; Andreote, F.D. Endo-and exoglucanase activities in bacteria from mangrove sediment. Braz. J. Microbiol. 2013, 44, 969-976.
• Bashan, Y.; Holguin, G. Plant growth-promoting bacteria: A potential tool for arid mangrove reforestation. Trees Struct. Funct. 2002, 16, 159-166.

タイトルに関連する用語 (5件)： 油流出 ,  マングローブ ,  メタゲノミクス ,  多機能 ,  β-N-アセチルヘキソサミニダーゼ