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J-GLOBAL ID：201902256750546803   整理番号：19A0780385

リベラルおよび保存性脊索動物ゲノムにおけるWnt進化と機能シャッフリング【JST・京大機械翻訳】

Wnt evolution and function shuffling in liberal and conservative chordate genomes

著者 (9件)： Somorjai Ildiko M. L. (Biomedical Sciences Research Complex, School of Biology, University of St Andrews, St Andrews, Scotland, UK) ,  Somorjai Ildiko M. L. (Scottish Oceans Institute, School of Biology, University of St Andrews, St Andrews, Scotland, UK) ,  Marti-Solans Josep (Departament de Genetica, , Microbiologia i Estadistica, and Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Diaz-Gracia Miriam (Departament de Genetica, , Microbiologia i Estadistica, and Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Nishida Hiroki (Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, Osaka University, Toyonaka, Japan) ,  Imai Kaoru S. (Department of Biological Sciences, Graduate School of Science, Osaka University, Toyonaka, Japan) ,  Escriva Hector (Sorbonne Universites, UPMC Univ Paris 06, CNRS, Biologie Integrative des Organismes Marins (BIOM), Observatoire Oceanologique, Banyuls/Mer, France) ,  Canestro Cristian (Departament de Genetica, , Microbiologia i Estadistica, and Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain) ,  Albalat Ricard (Departament de Genetica, , Microbiologia i Estadistica, and Institut de Recerca de la Biodiversitat (IRBio), Universitat de Barcelona, Barcelona, Spain)
資料名： Genome Biology (Web)  (Genome Biology (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 98  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7384A  ISSN： 1474-760X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 影響遺伝子損失は発生過程の進化に影響を及ぼし,機能シャッフリングは必須生物学的過程を駆動する保持遺伝子に影響を及ぼし,ゲノム進化とEvoDevoの分野において未解決の疑問を残している。これらの問題を調べるために,著者らは,事例研究として脊索動物門におけるWntリガンドレパートリーの進化を分析した。ゲノムデータベースにおけるWnt遺伝子の徹底的な調査を行い,13の非脊椎動物脊索動物における156のWnt遺伝子を同定した。これは脊索動物亜門の最も完全なWnt遺伝子カタログを表し,脊索動物において初めてWnt Aの同定を含む多くのWnt遺伝子のオーソログに関する以前のあいまいさを解決することを可能にした。さらに,著者らはナメamphiウオ発生時のWntファミリーに対する最初の完全な発現アトラスを作成し,脊索動物の放射線を通してWnt発現の進化を調べるための有用な資源を提供する。著者らのデータは,頭脊索動物における異常なゲノム停滞を強調し,それは,ウロ脊索動物ゲノムにおける遺伝子損失および重複の自由および動的進化パターンと対照的である。著者らの解析は,すべての脊索動物の間で共有される祖先Wnt機能,Wntパラログ間の機能シャッフリングのいくつかのケース,および各脊索系列における機能的革新を反映する可能性があるWnt遺伝子に対する独特の発現ドメインを推論することを可能にした。最後に,WntAの進化と脊索動物における口の進化の間の潜在的関係を提案した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 脊椎動物 ,  遺伝子 ,  事例研究 ,  遺伝子欠損 ,  曖昧さ ,  *ゲノム
準シソーラス用語： ドメイン構造 ,  *脊索 ,  パラロガス遺伝子 ,  オルソログ ,  Wnt遺伝子 ,  ゲノム進化 ,  *Wnt蛋白質 ,  *脊索動物門 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Wntの進化 ,  ゲノムの停滞 ,  遺伝子欠損 ,  機能シャッフル ,  Chordate WNT ,  ホヤ類 ,  脊椎動物 ,  ナメクジウオ

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (129件)：

• Nat Commun; Reconstruction of the ancestral metazoan genome reveals an increase in genomic novelty; J Paps, PWH Holland; 9; 2018; 1730; 10.1038/s41467-018-04136-5; citation_id=CR1
• Nat Commun; The Capsaspora genome reveals a complex unicellular prehistory of animals; H Suga, Z Chen, A de Mendoza, A Sebe-Pedros, MW Brown, E Kramer, M Carr, P Kerner, M Vervoort, N Sanchez-Pons; 4; 2013; 2325; 10.1038/ncomms3325; citation_id=CR2
• Annu Rev Genet; Duplication and divergence: the evolution of new genes and old ideas; JS Taylor, J Raes; 38; 2004; 615-643; 10.1146/annurev.genet.38.072902.092831; citation_id=CR3
• Semin Cell Dev Biol; Impact of gene gains, losses and duplication modes on the origin and diversification of vertebrates; C Cañestro, R Albalat, M Irimia, J Garcia-Fernandez; 24; 2013; 83-94; 10.1016/j.semcdb.2012.12.008; citation_id=CR4
• PLoS Genet; Consequences of lineage-specific gene loss on functional evolution of surviving paralogs: ALDH1A and retinoic acid signaling in vertebrate genomes; C Cañestro, JM Catchen, A Rodríguez-Marí, H Yokoi, JH Postlethwait; 5; 2009; e1000496; 10.1371/journal.pgen.1000496; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 保存 ,  脊索動物 ,  ゲノム ,  Wnt ,  進化